In this work we present results on the classification of $\mathbb{F}_{q^n}$-linear MRD codes of dimension three. In particular, using connections with certain algebraic varieties over finite fields, we provide non-existence results for MRD codes $\mathcal{C}=\langle x^{q^t}, F(x), G(x) \rangle \subseteq \mathcal{L}_{n,q}$ of exceptional type, i.e. such that $\mathcal{C}$ is MRD over infinite many extensions of the field $\mathbb{F}_{q^n}$. These results partially address a conjecture of Bartoli, Zini and Zullo in 2023.


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