基于核范数低秩表示的基因转录模块识别

项目名称： 基于核范数低秩表示的基因转录模块识别

项目编号： No.61402240

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 崔衍

作者单位： 南京邮电大学

项目金额： 26万元

中文摘要： 基因转录模块的识别能够帮助人们了解基因功能以及基因之间复杂的调控关系。为充分挖掘基因表达谱数据中蕴含的信息，本项目中，我们拟开展以下研究:(1) 结合基因表达数据特点，利用基因之间调控关系具有低秩性，采用核范数优化方法，设计出适合基因表达谱数据的低秩表示算法；(2)利用模式生物基因表达数据矩阵的低秩子矩阵，对基因进行功能聚类分析，发现具有特定功能的转录模块；(3)在对转录模块研究基础上，利用基因表达谱数据的低秩表示算法选择出相关性强的基因，推断出这些基因组成的子网络的结构，初步构建一些简单模式生物的基因调控网络。

中文关键词： 矩阵完备性；特征选择；基因表达谱；；

英文摘要： Gene transcriptional modules recognition is helpful for understanding the gene fuction, and helpful for deeply understanding the complicated gene regulation. In order to sufficiently mine the knowledge in gene expression data, in this research, we will st

英文关键词： matrix completion；feature selection；gene expression data；；