支原体的必需基因识别与核心基因组分析

项目名称： 支原体的必需基因识别与核心基因组分析

项目编号： No.11147182

项目类型： 专项基金项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 林岩

作者单位： 天津大学

项目金额： 5万元

中文摘要： 底盘是合成生物学工程化的基础，成功构建的基因线路需要植入底盘内才能可靠行使其功能。理想的底盘需要从头开始设计，而细菌必需基因与核心基因组的研究是自下而上构建底盘的关键。支原体是开展底盘生物的核心基因组研究的最好对象。本项目基于当前已测序支原体的基因组数据，从必需基因数据库（DEG）中的已知必需基因出发，借助基因组学和生物信息学技术，开发一种可靠的预测必需基因的新算法，对支原体的必需基因进行广泛识别，据此建立预测必需基因数据库（pDEG），并着重于对支原体的核心必需基因及核心基因组的构成进行系统分析，更好地理解支原体基因组的组织形式和分布规律，从而为理想底盘生物的人工设计与实现奠定基础。

中文关键词： 必需基因；支原体；基因组；算法；pDEG数据库

英文摘要：

英文关键词： Essential gene；Mycoplasma；Genome；Algorithm；pDEG database