项目名称: 蛋白琥珀酰新修饰的调控网络及其调控酶特异性底物的系统分析和功能研究
项目编号: No.31370814
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 生物科学
项目作者: 谭敏佳
作者单位: 中国科学院上海药物研究所
项目金额: 80万元
中文摘要: 本项目旨在利用基于质谱的定量蛋白质组学技术、泛修饰抗体技术、生物化学、生物信息学等手段,系统性研究不同物种细胞及受SIRT5调控的赖氨酸琥珀酰新型修饰通路底物和调控网络。通过赖氨酸琥珀酰修饰泛抗体亲和富集、结合质谱分析,来系统性研究大肠杆菌、酵母、果蝇、小鼠以及人等五种不同物种赖氨酸琥珀酰谱的分布情况,比较该新修饰通路在物种进化中的蛋白质组动态演变过程,阐述在物种进化过程中琥珀酰修饰核心细胞通路和调控网络。进一步地,利用细胞培养条件下稳定同位素标记技术(SILAC),结合抗体和质谱技术,系统性定量比较SIRT5缺陷细胞与野生型细胞中底物琥珀酰修饰化水平的变化, 来鉴定SIRT5调控的特异性底物和调控网络,并对相关生物学功能进行进一步验证和探索。由此系统性阐述琥珀酰新修饰通路和其调控酶SIRT5的底物、调控网络和分子作用机理,为深入认知该修饰通路的生物学功能、及相关疾病机制奠定基础。
中文关键词: 翻译后修饰;蛋白质组学;稳定同位素标记细胞培养;琥珀酰修饰;生物质谱
英文摘要: The aim of this project is systematic characterization of lysine succinylation (Ksucc) pathway and regulatory cellular networks using mass spectrometry (MS)-based quantitative proteomics, antibody-based technology, biochemistry, and bioinformatics approac
英文关键词: Post-translational modification;Proteomics;SILAC;Succinylation;Biological mass spectrometry