利用深度测序与比较元基因组学分析海绵共生微生物群落代谢潜力与生态学功能

项目名称： 利用深度测序与比较元基因组学分析海绵共生微生物群落代谢潜力与生态学功能

项目编号： No.41176127

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 海洋科学

项目作者： 李志勇

作者单位： 上海交通大学

项目金额： 68万元

中文摘要： 海绵在海洋生态系统的物质与能量循环中发挥着重要作用。目前对于海绵共生微生物的多样性已经比较了解，但是对于海绵共生微生物群落功能仍缺乏基本认识。海绵共生微生物群落的生态学功能是怎样的？这是海绵共生微生物研究急需回答的一个重要科学问题。传统分子技术及DNA测序技术无法很好回答这个问题，新一代深度测序与元基因组学、比较元基因组学的结合为回答这一问题提供了有力工具。项目针对一株南海浅海（约20m）海绵Holoxea sp.和一株大西洋深海（约2000m）海绵Lamellomorpha sp.）的胞内、胞外共生微生物群落的元基因组进行深度测序，通过比较元基因组学分析揭示相关功能基因、蛋白和代谢途径，预测海绵共生微生物群落在能量、营养、有害代谢产物去除、抗逆等方面的代谢潜力与生态学功能及其与微生物种群组成及胞外、胞内分布的关系。项目对于最终了解海绵共生微生物群落的功能及其与海绵宿主的关系具有重要意义。

中文关键词： 海绵共生微生物；群落基因组学；元基因组学；比较元基因组学；深度测序

英文摘要：

英文关键词： sponge microbial symbionts；community genomics；metagenomics；comparative metagenomics；deep sequencing