基于杂种优势潜在相关基因数据库的基因调控网络的构建与比较分析

项目名称： 基于杂种优势潜在相关基因数据库的基因调控网络的构建与比较分析

项目编号： No.30900831

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 宋述慧

作者单位： 中国科学院北京基因组研究所

项目金额： 20万元

中文摘要： 基于超级杂交稻LYP9亲本-父本（93-11）和母本（PA64s）-的全基因组序列，及用SAGE、EST测序、Microarray等技术界定的该杂交稻组合的全方位基因表达谱，我们鉴定了4千多个在子代与亲本间显著差异表达的基因。随着杂种优势研究的开展，在水稻以及其他作物中，越来越多的相关基因被发现。本项目拟通过整合用EST、SAGE、Microarray和Proteomics等技术检测到的杂交优势相关的基因，构建作物杂种优势潜在相关基因数据库，实现数据存储、查询、下载及分析工具模块的开发与可视化；并在本数据库的基础上，通过对芯片7个不同生长发育时期样本数据的基因共表达分析，结合已知物种基因间相互作用组的数据，构建水稻基因调控网络，进而构建杂种优势相关的调控网络，最终通过调控网络模块信息间的比较分析选取与杂种优势密切相关的基因进行功能研究，为揭示作物杂种优势的分子机理奠定基础。

中文关键词： 水稻杂种优势；数据库；调控网络；转录组测序；

英文摘要：

英文关键词： Rice heterosis；Database；Regulation network；RNA-seq；