项目名称: 构建对应于香菇全基因组序列的连锁图谱及分析农艺性状QTL
项目编号: No.31170098
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 微生物学、植物学
项目作者: 鲍大鹏
作者单位: 上海市农业科学院
项目金额: 55万元
中文摘要: 香菇是经济价值最大的食用菌品种,我国的产量和出口量均占世界首位。为了进一步加强香菇育种研究,提升我国香菇品种的品质,需要在香菇遗传背景和育种技术方面展开深入系统的研究。 本项目运用全基因组规模的SNP分子标记,建立对应于香菇全基因组序列的高密度遗传连锁图谱,根据此研究结果中所获得的连锁图谱中分子标记的连锁关系,可以优化香菇全基因组序列组装中Scafford的相对位置。 通过侧交和回交方法建立两种杂交群体,对香菇农艺性状进行QTL定位研究,分析不同杂交群体对香菇QTL定位的影响。结合全基因组序列分析主效QTL位点中的候选基因,并寻找与候选基因相关联的SNP等分子标记。 本项目的研究成果有助于促进香菇功能基因组学研究,有助于建立一种发掘功能候选基因的新方法,有助于促进香菇分子辅助育种体系的建立。
中文关键词: 香菇;遗传连锁图谱;数量性状位点;单核苷酸多态性;全基因组序列
英文摘要:
英文关键词: Lentinula edodes;genetic linkage map;quantitative trait locus;single nucleotide polymorphism;whole genome sequence