CDH1基因遗传变异与大肠癌的相关性及其介导上皮-间质转化进程的功能机制研究

项目名称： CDH1基因遗传变异与大肠癌的相关性及其介导上皮-间质转化进程的功能机制研究

项目编号： No.31371273

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 陈豪燕

作者单位： 上海交通大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 全基因组关联分析(GWAS)研究已识别出部分大肠癌易感基因，在后-GWAS时代对易感基因的功能验证成为功能基因组学的研究热点。16q22，即CDH1基因的所在区域，是GWAS发现的大肠癌易感基因之一。而对于16q22功能位点的精确定位及其功能验证尚未见报道。前期研究显示ZEB1与CDH1启动子区域结合可以下调CDH1的表达水平，进一步促进大肠癌上皮-间质转化进程。我们发现位于CDH1启动子区域的基因多态性 rs16260(A/C) SNP 正好处于ZEB1与CDH1的结合区域，并且荧光素酶报告基因实验显示该位点确实存在生物学功能。对该SNP的体内，体外功能验证及其与疾病预后的关系是本课题研究的主要内容。本研究将通过单倍域精确定位分析,人群基因组重测序技术精确定位CDH1基因上的功能位点，并将构建CDH1启动子缺失小鼠模型，以明确该SNP在大肠癌发生及其上皮-间质转化过程中所起的作用。

中文关键词： 大肠癌；CDH1基因遗传变异；染色质远距离调控；ZFP90；干性

英文摘要： Colorectal cancer(CRC) is one of the most common malignant tumors.Genome-wide association analysis located one of the susceptibility genes of CRC in 16q22 (CDH1 gene region).By bioinformatics analysis,we found that SNP rs16260 located in the promoter regi

英文关键词： colorectal cancer；CDH1 genetic variance；chromatin long distance regulation；ZFP90；stemness