转录组测序揭示乌骨绵羊乌质性状的功能基因及其TagSNP

项目名称： 转录组测序揭示乌骨绵羊乌质性状的功能基因及其TagSNP

项目编号： No.31360531

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 邓卫东

作者单位： 云南农业大学

项目金额： 48万元

中文摘要： 兰坪乌骨绵羊是我们发现并被农业部认定为第一个具有乌质性状的家畜遗传资源。本项目在乌骨绵羊成黑色素细胞于体内异向迁徙发育为黑色素细胞后反常分布于骨膜、肝脏、脾脏和肾脏并分泌黑色素形成乌质性状的研究基础上，以兰坪普通绵羊为对照，采用转录组测序（RNA-Seq）检测两品种1月龄和2岁时上述4种特定组织差异表达基因、新基因、编码SNP(cSNP)和可变剪切，构建乌质性状的基因调控网络；对关键基因进行Northern杂交和荧光定量验证；克隆2个关键差异表达基因和2个重要cSNP所在基因全序列；在两品种各100余个个体中初筛SNP，对SNP进行单倍型分析，锁定标签SNP（TagSNP）；利用MassARRAY进行大样本TagSNP检测，确立优势SNP；分析编码区和调控区SNP功能，通过报告基因、凝胶阻滞验证位点功能；从而获得乌骨绵羊乌质性状的主效基因或分子标记。研究结果为乌骨绵羊的开发和利用奠定基础。

中文关键词： 乌骨绵羊；黑色素；转录组；Rab21基因；关联分析

英文摘要： The Lanping black-boned sheep (Ovis aries), which were found by our team, are identified as the first mammal with black traits by the Ministry of Agriculture in China. This proposal is based on the interesting results that the melanoblast of black-boned s

英文关键词： Black-boned sheep；Melanin；Transcriptional；Rab21；Association analysis