项目名称: 基于组织特异网络模型的致病基因预测算法研究
项目编号: No.61402349
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 自动化技术、计算机技术
项目作者: 邓岳
作者单位: 西安电子科技大学
项目金额: 25万元
中文摘要: 预测遗传疾病的致病基因为遗传疾病的预防、诊断与治疗提供了靶标,已成为后基因组时代人类健康研究的重要挑战。尽管目前的致病基因预测算法研究已取得了大量成果,但绝大多数已有算法并未考虑疾病通常只会影响一个或少数几个组织的事实,导致大量与疾病所影响的组织无关的数据被引入,对预测的贡献很低甚至会造成负面影响。本项目拟利用组织特异数据滤除与预测疾病组织无关的数据,同时利用表型相似性刻画疾病间及基因间表型层面的关联关系,通过在分子网络上集成疾病组织特异数据与表型本体数据构建组织特异网络,提高数据的准确性和覆盖率。通过分析组织特异网络与普通网络的差异,针对组织特异网络的拓扑特征,研究基于异质网络挖掘的有效致病基因预测算法,并将其实现为软件工具。
中文关键词: 致病基因;组织特异性;生物医药本体;生物网络;
英文摘要: Disease gene prediction provides targets for the prevention,diagnosis and treatment of genetic diseases, and has become a fundamental challenge in the post-genomic era. Although many state of the art algorithms for the gene prediction problem have been pr
英文关键词: Disease Genes;Tissue-Specificity;Biomedical Ontologies;Biological Networks;