基于功能网络的疾病microRNA预测及模块识别方法

项目名称： 基于功能网络的疾病microRNA预测及模块识别方法

项目编号： No.61402138

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 韩轲

作者单位： 哈尔滨商业大学

项目金额： 26万元

中文摘要： MicroRNA（miRNA）的功能预测是当前生物信息学领域的研究热点。本项目首先发展由miRNA结点组成的功能网络构建方法，并在此基础上研究疾病miRNA预测及其功能模块的识别方法，以探索其在疾病中行使的功能。首先，提出一种考虑多种靶基因预测方法特点的贝叶斯加权方法，以建立可靠的靶基因集合。其次，提出一种结合靶基因互作上下文的miRNA功能相似性计算方法，进而基于聚类系数的阈值选择方法构建功能网络。然后，整合蛋白互作关系、miRNA间功能相似等多种信息建立双层网络，并提出基于双层网络的疾病miRNA预测方法，有效预测与给定疾病关联的miRNA。最后，研究基于疾病标签传播的模块识别方法，提出“传播力度”用以描述miRNA间关联疾病的一致性，有效识别疾病类别相关的miRNA功能模块。本项目对开拓新的疾病miRNA信息学预测方法有重要的理论意义，并在探索人类疾病发生机理方面具有潜在的应用价值。

中文关键词： 疾病microRNA预测；相似性计算；功能网络；功能模块识别；随机游走

英文摘要： MicroRNA (miRNA) function prediction is one of popular issues in bioinformatics. The project will develop the methods of constructing a functional network composed of miRNAs. On the basis of the functional network, it will also investigate the methods of

英文关键词： Disease microRNA prediction；Similarity calculation；Functional network；Functional module identification；Random walk