基于C-空间理论的基因调控网络构建与解析方法研究

项目名称： 基于C-空间理论的基因调控网络构建与解析方法研究

项目编号： No.61373105

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 周小波

作者单位： 同济大学

项目金额： 75万元

中文摘要： 对基因调控网络进行深入研究能从系统角度全面揭示基因组的功能和行为，有助于系统地理解细胞活动，解释疾病与治疗的机理。本项目主要开展以下研究：基于基因之间调控关系的稀疏性特性，利用基因表达谱数据，并结合基因组、ChIP-chip数据，绘制基因调控网络结构草图，在此基础上，基于概率图模型，构建出近似逼近真实结构的基因调控网络；从基因与基因的关系入手，发展差异共表达分析基本理论与算法，识别差异调控基因，在此基础上构建差异调控子网路：借鉴欧氏空间等概念，创新性地提出适于基因调控网络分析的拟几何随机图空间理论（我们称其为C-空间理论），并提出基于C-空间理论的重叠模块挖掘方法。本项目的成功实施将形成一套规范的基因调控网络计算理论分析方法和支撑工具，这将为我国利用基因调控网络技术，提升生物学基础研究水平，提供系统框架和技术平台支撑。

中文关键词： 生物信息；病人亚型分类；基因调节网；；

英文摘要： A deep study of Gene Regulatory Network (GRN) will be able to completely uncover the function and behavior of genome from the viewpoint of systems and be helpful to understand cellular activity as well as reveal the mechanism of disease and therapy. This

英文关键词： Bioinformarics；patient stratification；Gene Regulatory Network；；