识别肿瘤基因标志物的计算方法及应用

项目名称： 识别肿瘤基因标志物的计算方法及应用

项目编号： No.61373057

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 李小波

作者单位： 丽水学院

项目金额： 73万元

中文摘要： 识别有效可靠的肿瘤基因标志物是肿瘤研究的一个重要课题。尽管结直肠癌转移是结直肠癌患者的主要死因，但其分子机理尚未完全明了。进一步研究结直肠癌转移相关基因，发现、鉴定与验证结直肠癌转移相关基因标志物，是结直肠癌基础研究的重要方向之一。课题组采用高通量基因芯片数据，融合蛋白质相互作用网络数据，将创新的肿瘤标志物识别算法用于结直肠癌转移机制的研究，多标准、多层面、多途径挖掘结直肠癌转移相关基因。课题组提出了多标准融合的肿瘤特征基因选择方法，以改进现有基因选择算法的鲁棒性；提出了基于蛋白质相互作用网络的肿瘤基因标志物识别方法，对基因表达谱数据和蛋白质相互作用网络数据进行整合分析；对筛选的候选基因进行生物学验证研究，以期找到新的结直肠癌转移相关基因。与此同时，建立起一套进行肿瘤基因标志物识别的通用生物信息学技术和方法，用以帮助其他类型肿瘤的分子生物学研究。

中文关键词： 肿瘤相关基因；整合分析；基因选择；多类别癌症分类；肿瘤转移

英文摘要： Identification of effective and reliable tumor genetic markers is an important topic in cancer research. Although metastasis is the principal cause of death for colorectal cancer patients, the molecular mechanism of colorectal metastasis remains far from

英文关键词： tumor related genes；integrated study；gene selection；multi-category tumor classification；tumor metastasis