项目名称: 计算识别化合物体内作用靶标的方法及应用
项目编号: No.30970690
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 陈新
作者单位: 浙江大学
项目金额: 32万元
中文摘要: 现代药物研发的一个主要途径是通过设计可选择性作用于特定靶标蛋白的小分子来产生治疗作用。但是,药物分子通常不仅能与既定靶标作用,还能与许多其它蛋白结合,导致预期之外的副作用,有时也会产生新的有效用途。众多例子提示我们,在新药研发初期就需要考虑化合物可能结合的多个靶标,在整个生命系统的背景下评估继续研发的价值。此外,最新实验表明现有药物的新组合能够产生无法预期的治疗效果,也提示我们通过分析临床有效组合药物的多个靶标,了解它们协同调控的机制,可以帮助我们设计新的高效安全的分子干预策略来对抗复杂顽固疾病。上述这些研究的关键之一是如何有效识别化合物体内作用的所有可能靶标。我们曾在2003年成功设计了一种预测化合物靶标的算法,但随着相关领域的快速发展,这一工作在许多方面已显不足。在本项目中,我们拟利用相关的最新进展,重建计算识别化合物体内作用靶标的技术体系,并系统评估该技术在上述几方面研究中的应用。
中文关键词: 靶标识别;反向对接;序位回归;蛋白间打分噪音;药物组合
英文摘要:
英文关键词: target identification;reverse docking;rank regression;inter-protein scoring noises;drug combination