柑橘单核苷酸多态性分子标记的开发及其在杂种区分和柚品种遗传多态性研究中的应用

项目名称： 柑橘单核苷酸多态性分子标记的开发及其在杂种区分和柚品种遗传多态性研究中的应用

项目编号： No.30971992

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 钟广炎

作者单位： 中国农业科学院柑桔研究所

项目金额： 27万元

中文摘要： 采用计算机软件包处理现有柑橘表达序列标签（EST）DNA序列数据，剔除载体、克隆和测序误差、异位同祖基因（paralogous gene）等干扰因素，筛查高质量候选单核苷酸多态性分子标记（SNP）10000个，收录到SNP数据库。根据实验室现有技术要求，设计候选SNP的PCR引物，采用PCR-SSCP(单链构象多态性)、PCR-RFLP（限制性酶切片段多态性）、荧光定量PCR、必要时测序等技术试验验证候选SNP。利用验证了的具有多态性的SNP标记，分析50份柚品种资源的10个SNP位点，研究柚品种资源的遗传多态性，探讨柚品种起源和相互间的亲缘关系，建立重要柚品种基于SNP分子标记的DNA条码。同时，利用SNP区分1000株以上的柑橘多胚杂交苗。

中文关键词： 单核苷酸多态性；基因分型；柑橘；杂种鉴定；DNA条码

英文摘要：

英文关键词： SNP；genotyping；citrus；identification of zygots；DNA barcode