项目名称: 动脉粥样硬化发生发展过程中关键节点和调控网络的系统生物学研究
项目编号: No.91439103
项目类型: 重大研究计划
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 陈洛南
作者单位: 中国科学院上海生命科学研究院
项目金额: 170万元
中文摘要: 动脉粥样硬化是心脑血管疾病的主要原因之一,其发生发展不仅是一个非线性的稳态失衡过程,而且涉及到复杂分子网络的动态调控。本项目由理论计算和实验验证相结合的系统生物学研究模式,建立动脉血管稳态失衡从而导致粥样硬化的数学模型,开发基于系统科学和动力系统理论等的粥样硬化早期诊断方法,近一步确定稳态失衡的关键节点和关键分子网络。(1)通过整合生物医学大数据,基于双聚类算法和矩阵分解模型,推断动脉血管稳态失衡过程中的基因、蛋白质、代谢分子间的调控关系,建立动脉粥样硬化过程的分子调控网络。(2)通过整合基因、蛋白质、代谢等多层次网络,确定刻画稳态失衡过程的动态网络标记物及其活性分子群,得到疾病发生发展过程的关键节点和关键网络,从网络层次解析脂质代谢紊乱和炎症导致动脉粥样硬化的致病机理。(3) 建立动脉粥样硬化的发病前兆检测方法和基于单样本采样的发病前兆预测模型,由动物模型实验验证所得到的计算和理论结果。
中文关键词: 系统生物学;动态网络标志物;网络标志物;生物信息学;动脉粥样硬化
英文摘要: Atherosclerosis is one of the major factors causing cardiovascular diseases including myocardial infarction. The onset and progression of atherosclerosis resulted from dysregulation of the blood vessel homeostasis involve complicated dynamic regulations a
英文关键词: systems biology;dynamic network biomarker;network biomarker;bioinformatics;Atherosclerosis