同源三倍体水稻基因组DNA甲基化研究

项目名称： 同源三倍体水稻基因组DNA甲基化研究

项目编号： No.30971618

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 吴先军

作者单位： 四川农业大学

项目金额： 32万元

中文摘要： 多倍化是植物进化的重要方式，多倍化后DNA甲基化修饰变异调控多倍体基因表达，进而影响进化的历程。过去对多倍体甲基化研究多针对个别基因，没有多倍体全基因组DNA甲基化修饰图谱的报道，无法在基因组水平上详细分析DNA甲基化对多倍体基因表达与进化的影响。本项目拟采用来自水稻双胚苗中遗传背景相同，仅具倍性差异的同源三倍体与对应二倍体为材料，按DNA甲基免疫沉淀与tiling芯片杂交相结合的技术方案(ChIPchip)，建立水稻同源三倍体全基因组高分辨率甲基化变异图谱。在基因组水平上，详细分析多倍化后DNA甲基化修饰变化；分析DNA甲基化对多倍体染色质结构的影响；结合已有编码基因和小RNA表达资料，探讨多倍体DNA甲基化对基因表达的调控机理，并通过亚硫酸盐测序和实时PCR进行验证。项目研究结果将为植物多倍体进化中表观遗传调控机制的揭示奠定基础。

中文关键词： 水稻；倍性；甲基化；小RNA；基因表达

英文摘要：

英文关键词： rice；ploidy level；methylation；small RNA；gene expression