基于CHIP-SEQ数据的microRNA启动子区域预测及转录因子结合位点分析

项目名称： 基于CHIP-SEQ数据的microRNA启动子区域预测及转录因子结合位点分析

项目编号： No.60901075

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 汪国华

作者单位： 哈尔滨工业大学

项目金额： 20万元

中文摘要： 阐明基因转录调控与转录后调控机制是后基因组时代的研究热点。microRNA是转录后调控基因表达的一类重要非编码RNA，近年来，生物学家揭示了许多microRNA的生物特性及其与疾病的关系，但对microRNA初始转录产物特性的研究进展缓慢。CHIP-SEQ数据的出现，为发展生物信息学方法，预测microRNA基因的启动子及转录因子结合位点，从而更好地阐明初始转录产物的生物学特性奠定了基础。 本课题依托RNA聚合酶Ⅱ#21450;组蛋白各种修饰的 CHIP-SEQ数据，研究基于CHIP-SEQ数据的启动子区域表示模型，设计模式参数学习算法在microRNA上游区域预测启动子，分析启动子基因组特征及转录因子结合位点；开发microRNA启动子预测软件及数据库系统，完善对microRNA初始转录产物的注释。本课题成果将为生物学家研究microRNA基因结构及microRNA中潜在的基因调控机制提供有力支持。

中文关键词： miRNA；RNA聚合酶Ⅱ#65307;启动子；CHIP-SEQ；转录因子

英文摘要：

英文关键词： miRNA；RNA Polymerase II；Promoter；CHIP-SEQ；Transcription Factor