项目名称: 二维凝胶图像中差异蛋白点提取技术研究

项目编号: No.61163047

项目类型: 地区科学基金项目

立项/批准年度: 2012

项目学科: 计算机科学学科

项目作者: 熊邦书

作者单位: 南昌航空大学

项目金额: 49万元

中文摘要: 蛋白质组学是生命科学的研究热点,凝胶图像的差异蛋白质点提取是蛋白质组学研究的主要手段之一,在方法研究上已取得不少成果,但存在饱和、重叠蛋白质点分割难,传统方法过分割,图像局部几何变形和背景不一致对蛋白质点的匹配精度有影响,差异蛋白质点的准确量化等问题。本项目探索凝胶图像中蛋白质点成像机理,建立各类蛋白质点的数学模型,采用三次分水岭、图像形态学、内外标记强加等方法,研究能同时很好地解决饱和、重叠蛋白质点分割及过分割问题的蛋白质点检测方法;通过数值分析、实验验证和方法研究,建立凝胶图像间的局部变换关系,提出不需人工介入,不受几何变形和背景影响的高精度匹配方法;采用数学模型和曲面重建方法,提出能真实反映蛋白质差异的定量表示方法。 预期成果将给出准确度、可重复性和自动化程度高的差异蛋白质点提取方法,丰富、扩充和发展蛋白质组学研究的技术,为我国开发具有自主知识产权的凝胶图像分析软件提供核心方法。

中文关键词: 二维凝胶图像;蛋白质点检测;蛋白质点匹配;差异蛋白质点提取;分水岭变换

英文摘要:

英文关键词: 2D gel images;protein spot detection;protein spot matching;differencial spot extraction;watershed transform

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