二维凝胶图像中差异蛋白点提取技术研究

项目名称： 二维凝胶图像中差异蛋白点提取技术研究

项目编号： No.61163047

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 计算机科学学科

项目作者： 熊邦书

作者单位： 南昌航空大学

项目金额： 49万元

中文摘要： 蛋白质组学是生命科学的研究热点，凝胶图像的差异蛋白质点提取是蛋白质组学研究的主要手段之一，在方法研究上已取得不少成果，但存在饱和、重叠蛋白质点分割难，传统方法过分割，图像局部几何变形和背景不一致对蛋白质点的匹配精度有影响，差异蛋白质点的准确量化等问题。本项目探索凝胶图像中蛋白质点成像机理，建立各类蛋白质点的数学模型，采用三次分水岭、图像形态学、内外标记强加等方法，研究能同时很好地解决饱和、重叠蛋白质点分割及过分割问题的蛋白质点检测方法;通过数值分析、实验验证和方法研究，建立凝胶图像间的局部变换关系，提出不需人工介入，不受几何变形和背景影响的高精度匹配方法;采用数学模型和曲面重建方法，提出能真实反映蛋白质差异的定量表示方法。 预期成果将给出准确度、可重复性和自动化程度高的差异蛋白质点提取方法，丰富、扩充和发展蛋白质组学研究的技术，为我国开发具有自主知识产权的凝胶图像分析软件提供核心方法。

中文关键词： 二维凝胶图像；蛋白质点检测；蛋白质点匹配；差异蛋白质点提取；分水岭变换

英文摘要：

英文关键词： 2D gel images；protein spot detection；protein spot matching；differencial spot extraction；watershed transform