项目名称: 基于基因共表达网络鉴定葡萄干旱调控路径中NAC转录因子的功能
项目编号: No.31201607
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 农业科学
项目作者: 蔡斌
作者单位: 南京农业大学
项目金额: 25万元
中文摘要: 我国三分之一以上的葡萄种植区位于干旱和半干旱地区,干旱使葡萄生长发育产生生理障碍,降低葡萄产量,影响葡萄浆果及葡萄酒品质。植物中NAC基因家族的一些成员参与植物的抗旱反应。基因共表达网络已成为基因功能、基因调控路径研究方面的重要工具。基因共表达网络模块中的基因存在共表达特性,它们参与到一个相对独立的生物学过程。本研究拟利用生物信息学的方法构建一张葡萄基因共表达网络,通过对网络特性的分析将网络分离成各功能模块。在全基因组水平上提取存在于网络模块中的NAC基因家族成员,经过芯片数据分析和qRT-PCR初步筛选对干旱有响应的NAC基因家族成员。通过在葡萄中过量表达这些候选NAC基因来研究同一个网络模块中其他基因的表达情况,从而得到受NAC基因过量表达影响的其他基因,初步推测受干旱诱导的NAC转录因子的调控路径。
中文关键词: NAC;基因共表达网络;基因家族;干旱;顺式作用元件
英文摘要: Drought stress affects grape growth and causes decreases in crop productivity and quality of fruit and wine under water-deficit conditions in one third of China. The role of NAC transcription factors in drought stress tolerance have been proved in plants.
英文关键词: NAC;gene co-expression network;gene family;drought;cis-regulatory element