结直肠癌易感区域中转录因子和miRNA结合位点调控型遗传变异的识别与验证

项目名称： 结直肠癌易感区域中转录因子和miRNA结合位点调控型遗传变异的识别与验证

项目编号： No.81402744

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 医药、卫生

项目作者： 龚静

作者单位： 华中科技大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 结直肠癌全基因组关联研究(GWAS)发现的易感位点多数位于非编码区，且具体机制尚不完全清楚，因此，对已报道的结直肠癌易感区域中的功能性遗传变异进行深入挖掘和验证很有必要。我们前期研究表明，miRNA和转录因子靶基因结合位点上存在大量的单核苷酸多态，可通过改变miRNA和转录因子的结合而成为“调控型遗传变异”。本项目将利用国内外结直肠癌GWAS成果，在其鉴定的易感区域中，首先运用生物信息学方法整合多种数据库信息和软件预测结果，预测可能影响miRNA和转录因子功能的调控型遗传变异。然后，采用大样本“病例-对照研究”策略，揭示预测的调控型遗传变异与中国人群结直肠癌的易感性关系。最后，通过电泳迁移率实验和报告基因实验等分子生物学手段，探索这些调控型遗传变异潜在的生物学机制。本研究有助于发现与结直肠癌患病风险相关的功能性遗传变异，并为进一步探索调控因子在结直肠癌发生发展中的作用提供新的线索。

中文关键词： 结直肠癌；单核苷酸多态性；转录因子；微小RNA；遗传易感性

英文摘要： Genome-wide association study (GWAS) found that most of the genetic susceptibility variants for colorectal cancer (CRC) are located in non-coding regions and the mechanism of these variants are not completely clear, therefore, it is necessary to explore f

英文关键词： colorectal cancer；single nucleotide polymorphisms；transcription factor；microRNA；genetic susceptibility