蛋白质相互作用及结合位点的预测方法研究

项目名称： 蛋白质相互作用及结合位点的预测方法研究

项目编号： No.61402326

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 郭菲

作者单位： 天津大学

项目金额： 26万元

中文摘要： 蛋白质相互作用研究是蛋白质组学的一个重要内容。蛋白质在生命活动过程中通过相互作用实现特定的生物功能。如何更有效地对蛋白质的序列信息、结构信息和物化特性建模，是预测蛋白质相互作用的关键。本项目旨在研究蛋白质相互作用及结合位点的预测问题：(1)研究蛋白质共进化对蛋白质相互作用的影响。设计基于蛋白质共进化的预测方法，分析蛋白质相互作用关系。(2)利用合理的结构模型，建立基于局部序列信息和局部结构信息的蛋白质结合位点知识库。比较预测残基和知识库中结合位点的局部信息相似性，识别蛋白质结合位点残基。(3)研究相互作用界面的两个新特性：结合位点残基所形成的二面角和相互作用芳香环平面之间的相对位置。构造概率图模型拟合新特性取值的概率分布，预测相互作用界面的三维构象。本项目将针对分子生物学中蛋白质之间相互作用预测，提出更高效准确的计算方法，为蛋白质组学研究提供新思路。

中文关键词： 生物信息学；蛋白质相互作用；结合位点；相互作用网络；蛋白质复合物

英文摘要： Studies on protein-protein interaction are important in proteome research. In biological processes, proteins achieve the biological functions through protein-protein interactions. How to build more effective models based on protein sequence information, p

英文关键词： Bioinformatics；Protein-Protein Interaction；Binding Sites；PPI Network；Protein Complex