染色体3q13和5p13区域遗传变异与胃癌易感性的分子流行病学研究

项目名称： 染色体3q13和5p13区域遗传变异与胃癌易感性的分子流行病学研究

项目编号： No.81202267

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 预防医学、地方病学、职业病学、放射医学

项目作者： 戴俊程

作者单位： 南京医科大学

项目金额： 23万元

中文摘要： 幽门螺旋杆菌感染(H. pylori)是胃癌发生的主要危险因素之一，但仅小部分感染者最终罹患胃癌，提示胃癌的发生是环境和遗传因素共同作用的结果。本课题组最新全基因组关联研究发现，染色体3q13和5p13区域可能是胃癌的重要易感区域，但该区域遗传变异在胃癌发生中的具体遗传机制尚未阐明。本研究在前期工作的基础上，拟通过对上述两个区域进行重测序，结合千人基因组计划(1000 Genome)和人类单倍型计划(Hapmap)数据库，采用大样本精细作图研究以及分子生物学手段深入探讨：①染色体3q13和5p13区域的遗传变异在中国人群胃癌发生中的作用；②基因-基因、基因与环境暴露之间的交互作用；③相关遗传变异对候选易感基因(如PTGER4、PRKAA1和ZBTB20)的调控机制。研究结果将为胃癌发生机制的阐明提供理论基础，所发现的遗传标志物可为胃癌高危人群的筛查和早诊早治提供科学依据。

中文关键词： 全基因组关联研究；胃癌；分子；流行病学；

英文摘要： Although H.pylori infection is one of the major risk factors for gastric cancer, only a small proportion of infected individuals develop gastric cancer, suggesting that both environmental and genetic factors play important roles in gastric cancer pathogenesis. Our latest gastric cancer GWAS study have identified two new susceptibility loci at 3q13 and 5p13 region, however, the exact genetic etiology and mechanisms of gastric cancer in these regions are unclear. On the basis of our previous GWAS study and combing with the databases of 1000 Genomes and Hapmap, this project is proposed to firstly resequence the GWAS-reported regions using Next-generation sequencing(NGS) technology, then perform fine-mapping study and related molecular biology assays by using a large-sample case-control design. Three aspects will be considered in the project: 1. Identify the genetic variations in 3q13 and 5p13 regions related to gastric cancer in Chinese population; 2. Detect gene-gene and gene-environmental interactions between genetic variants and related risk factors; 3. Reveal the regulatory mechanisms of the relevant genetic variations of susceptibility genes(such as PTGER4, PRKAA1 and ZBTB20). The results of this project could improve understanding of the etiology and mechanisms of gastric cancer development, which in turn is

英文关键词： GWAS；Gastric cancer；Molecular；Epidemiology；