全基因组DNA甲基化研究中的统计学方法

项目名称： 全基因组DNA甲基化研究中的统计学方法

项目编号： No.11371101

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 张洪

作者单位： 复旦大学

项目金额： 50万元

中文摘要： 本项目致力于解决全基因组DNA甲基化研究中的一些重要统计学问题。DNA甲基化模式异常是环境与基因交互作用的结果，它是包括癌症在内的很多疾病之先兆，也跟疾病预后有密切关系，因此与疾病相关的DNA甲基化标记可用于研究疾病的发生发展机理，并可以用于疾病的早期诊断和预后分析；年龄相关DNA甲基化模式异常除与寿命相关外，还往往和很多疾病密切相关。因此，筛选疾病/年龄相关DNA甲基化标志具有重要的实际意义。本项目将基于目前常用的全基因组DNA甲基化研究，探讨用于筛选疾病/年龄相关DNA甲基化标记的统计学方法。对于病例-对照设计/队列设计/横断设计下的全基因组DNA甲基化研究，我们将提出新的概率模型以联系疾病/年龄和DNA甲基化模式及其他协变量，基于新模型发展相应的统计方法用来检测疾病/年龄相关DNA甲基化标志，并研究新模型和统计方法的理论性质。

中文关键词： 高通量；DNA甲基化；RNA测序；DNA测序；

英文摘要： We aim at resolving some important statistical problems arising from genomewide DNA methylation studies. Aberrant DNA methylation pattern is a result of the interaction of genetic and environmental effects, it is uaually an indicator of human dieases incl

英文关键词： high-throughput；DNA methylation；RNA-seq；DNA-seq；