矩阵分解在基因组关联研究中的应用

项目名称： 矩阵分解在基因组关联研究中的应用

项目编号： No.10901042

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 张淑芹

作者单位： 复旦大学

项目金额： 16万元

中文摘要： 基因组关联性的研究是近年来刚兴起的课题，它主要通过研究基因组中的某些基因标记与疾病的关联性，从而来研究某些基因与疾病的联系。本项目研究矩阵分解在基因组关联中的应用，主要通过研究病人和常人的基因标记SNPs数据的不同模式，来研究其与疾病的关系。包括对SNPs数据得到的数字表示矩阵进行分解从而找出其中的一些特征、对数字矩阵分解的算法研究以及对最终得到的理论结果在实际实验数据中的分析等等。本课题是多学科交叉的课题，包括数学、生物信息学、医学等各方面。据我们所知，目前对于基因组关联的研究主要运用统计学的方法，本课题试图直接从矩阵分解的角度分析得到的实验数据，是在此领域的一个尝试，许多相关的研究都还处于探索阶段，需要更多的研究人员的参与。因此，我们期待该课题的立项，以便更有利的开展研究工作。它的立项无论对于数学还是生物信息学、医学的发展都有着重要的理论和实践意义。

中文关键词： 数学建模；矩阵分解；数值计算；基因功能；

英文摘要：

英文关键词： Mathematical modeling；matrix factorization；numerical computation；gene function；