项目名称: 基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究
项目编号: No.61161004
项目类型: 地区科学基金项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 无线电电子学、电信技术
项目作者: 吴凌伟
作者单位: 南昌大学
项目金额: 47万元
中文摘要: 湖区环境污染问题引起广泛关注,及时快速准确地监测鄱阳湖区的生态环境状况是发展生态经济的重 要保证。微生物的分布是湖区生态环境的一个重要 指标。由于核糖体RNA和它的基因具有很好的保守性,可作为可靠的微生物生态学标志,用来计算自然界物种之间的亲缘关系,因此核糖体DNA基因广泛应 用于分子基因分析。本研究以微生物16S RNA基因为 研究对象,使用最新高通量测序技术,测出某一区域所有微生物的16SRNA基因序列,通过生物 信息学分析,找出物种的特异性序列及其丰度,从 而得出该地区微生物的分布情况。本项目已开展了初步研究,我们对鄱阳湖的一个特定区域取样,进行了测序研究,测定的结果较能真实反应微生物的分布情况。本研究提出了一种新型的研究微生物生态方法,具有高通量和高准确性,可供对流域内污染源及污染治理情况进行数据分析,为江西工业可持续发展及科学发展规划提供依据。
中文关键词: 微生物多样性;鄱阳湖;高通量测序;环境微生物学;生物信息学
英文摘要:
英文关键词: microbial diversity;Poyang Lake;High-throughput sequencing;environmental microbiology;Bioinformatics