自COVID-19疫情爆发以来,流行病学模型的研究受到了越来越多的关注。传统的机制模型通过数学方式描述传染病的传播机制,但在面对当今不断增长的挑战时往往力不从心。因此,图神经网络(Graph Neural Networks, GNNs)逐渐成为流行病研究中的一种流行工具。本文旨在对GNNs在流行病任务中的应用进行全面综述,并突出潜在的未来研究方向。为实现这一目标,我们为流行病任务和方法引入了层次分类法,提供了该领域的发展轨迹。对于流行病任务,我们建立了类似于流行病领域常用的分类法;对于方法论,我们将现有的工作分为神经模型和混合模型。随后,我们对这些方法进行了详尽且系统的审查,涵盖了任务及其技术细节。此外,我们还从多个角度讨论了现有方法的局限性,并系统性地提出了未来的研究方向。我们希望本教程能够为研究人员提供有价值的资源,深入探讨当代GNN模型在流行病学中的应用,同时也为未来的探索指明方向。

教程大纲

本次全天教程的主题包括(但不限于)以下内容: * 图论和图傅里叶分析 * 图神经网络的基础 * 机械模型 * 流行病学中的混合模型 * 用于流行病建模的EpiLearn软件包

教程的具体安排如下:

  1. 引言和背景介绍(20分钟)

流行病建模 * 图机器学习和图神经网络

  1. 综合分类法(40分钟)

流行病学任务 * 流行病学数据集 * 图的构建

  1. 休息(15分钟)
  2. 探索神经模型和混合模型(60分钟)

方法学特征 * 神经模型 * 混合模型

  1. 休息(15分钟)
  2. EpiLearn:用于流行病数据建模和分析的Python库(10分钟)
  3. 未来方向和结论(20分钟)

大规模流行病建模 * 流行病学中的跨模态应用 * 流行病扩散过程 * 流行病干预措施 * 生成可解释的预测 * 解决流行病数据中的挑战

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