Introduction: The Oncotype DX (ODX) test is a commercially available molecular test for breast cancer assay that provides prognostic and predictive breast cancer recurrence information for hormone positive, HER2-negative patients. The aim of this study is to propose a novel methodology to assist physicians in their decision-making. Methods: A retrospective study between 2012 and 2020 with 333 cases that underwent an ODX assay from three hospitals in Bourgogne Franche-Comt{\'e} was conducted. Clinical and pathological reports were used to collect the data. A methodology based on distributional random forest was developed using 9 clinico-pathological characteristics. This methodology can be used particularly to identify the patients of the training cohort that share similarities with the new patient and to predict an estimate of the distribution of the ODX score. Results: The mean age of participants id 56.9 years old. We have correctly classified 92% of patients in low risk and 40.2% of patients in high risk. The overall accuracy is 79.3%. The proportion of low risk correct predicted value (PPV) is 82%. The percentage of high risk correct predicted value (NPV) is approximately 62.3%. The F1-score and the Area Under Curve (AUC) are of 0.87 and 0.759, respectively. Conclusion: The proposed methodology makes it possible to predict the distribution of the ODX score for a patient and provides an explanation of the predicted score. The use of the methodology with the pathologist's expertise on the different histological and immunohistochemical characteristics has a clinical impact to help oncologist in decision-making regarding breast cancer therapy.


翻译:导言:Oncotym DX(ODX)测试是用于乳腺癌检测的商业可用分子测试,为荷尔蒙阳性、HER2-阴性病人提供预测性和预测性乳腺癌复发信息。本研究的目的是提出协助医生决策的新方法。方法:2012年至2020年期间进行了一项回顾研究,从Bourgogne Franche-Comt }三家医院对333个病例进行了ODX(ODX)检测,对92%的低风险病人和40.2%的高风险病人进行了正确分类。总体准确度为79.3%。基于分布随机森林的预测值方法(PPV)使用9个临床病理学特征。这种方法可以特别用来确定与新病人有相似之处的培训组的病人患者,并预测ODX的分布。结果:对59%的参与者的平均年龄为56.9岁。我们正确地分类了92%的低风险病人和40.2%的病人的治疗。总体准确度为79.3%。低风险预测值的比例(PPV)是82%的临床病理学特征。高风险值的预测值比例为82%。在FX中,而GLAUR值的预测值的计算方法则为62:高风险值的正确值的预测值的比值为6比值的比值为62。</s>

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