We propose Adaptive Deep Kernel Fitting (ADKF), a general framework for learning deep kernels by interpolating between meta-learning and conventional learning. Our approach employs a bilevel optimization objective where we meta-learn feature representations that are generally useful across tasks, in the sense that task-specific Gaussian process models estimated on top of such features achieve the lowest possible predictive loss on average across tasks. We solve the resulting nested optimization problem using the implicit function theorem. We show that ADKF contains Deep Kernel Learning and Deep Kernel Transfer as special cases. Although ADKF is a completely general method, we argue that it is especially well-suited for drug discovery problems and demonstrate that it significantly outperforms previous state-of-the-art methods on a variety of real-world few-shot molecular property prediction tasks and out-of-domain molecular optimization tasks.


翻译:我们提出“适应性深内心健身”(ADKF),这是一个通过将元学习与常规学习相互交错来学习深内核的一般框架。我们的方法采用双层优化目标,即我们在各项任务中通常有用的元中分物表,即根据特定任务而估算的高斯进程模型,在此类任务中平均平均可产生最低的预测损失。我们用隐含功能的理论解决由此造成的嵌套优化问题。我们显示,ADKF包含深海内核学习和深内核转移,作为特殊案例。虽然ADKF是一种完全通用的方法,但我们认为它特别适合药物发现问题,并表明它大大地超越了以前在各种现实世界中微小分子属性预测任务和外部分子优化任务方面的最先进方法。

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