Network traffic classification using pre-training models has shown promising results, but existing methods struggle to capture packet structural characteristics, flow-level behaviors, hierarchical protocol semantics, and inter-packet contextual relationships. To address these challenges, we propose FlowletFormer, a BERT-based pre-training model specifically designed for network traffic analysis. FlowletFormer introduces a Coherent Behavior-Aware Traffic Representation Model for segmenting traffic into semantically meaningful units, a Protocol Stack Alignment-Based Embedding Layer to capture multilayer protocol semantics, and Field-Specific and Context-Aware Pretraining Tasks to enhance both inter-packet and inter-flow learning. Experimental results demonstrate that FlowletFormer significantly outperforms existing methods in the effectiveness of traffic representation, classification accuracy, and few-shot learning capability. Moreover, by effectively integrating domain-specific network knowledge, FlowletFormer shows better comprehension of the principles of network transmission (e.g., stateful connections of TCP), providing a more robust and trustworthy framework for traffic analysis.


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