Synthetic data generated by generative models can enhance the performance and capabilities of data-hungry deep learning models in medical imaging. However, there is (1) limited availability of (synthetic) datasets and (2) generative models are complex to train, which hinders their adoption in research and clinical applications. To reduce this entry barrier, we propose medigan, a one-stop shop for pretrained generative models implemented as an open-source framework-agnostic Python library. medigan allows researchers and developers to create, increase, and domain-adapt their training data in just a few lines of code. Guided by design decisions based on gathered end-user requirements, we implement medigan based on modular components for generative model (i) execution, (ii) visualisation, (iii) search & ranking, and (iv) contribution. The library's scalability and design is demonstrated by its growing number of integrated and readily-usable pretrained generative models consisting of 21 models utilising 9 different Generative Adversarial Network architectures trained on 11 datasets from 4 domains, namely, mammography, endoscopy, x-ray, and MRI. Furthermore, 3 applications of medigan are analysed in this work, which include (a) enabling community-wide sharing of restricted data, (b) investigating generative model evaluation metrics, and (c) improving clinical downstream tasks. In (b), extending on common medical image synthesis assessment and reporting standards, we show Fr\'echet Inception Distance variability based on image normalisation and radiology-specific feature extraction.
翻译:基因模型产生的合成数据可以提高医学成像中数据饥饿深度学习模型的性能和能力,然而,有(1) (合成) 数据集的可用性有限,而且(2) 基因模型复杂,难以培训,妨碍在研究和临床应用中采用这些数据。为减少这一进入障碍,我们提议建立Medigan,这是作为开放源框架框架-遗传学Python图书馆实施的经过训练的基因模型的一站式商店。 药物模型使研究人员和开发人员能够仅用几行代码创建、增加和调整其培训数据。在根据收集的最终用户要求作出设计决定后,我们采用基于基因模型模块组成部分的Medigan (一) 执行, (二) 可视化, (三) 搜索和排名, (四) 贡献。 图书馆的可缩放和设计体现在其越来越多的综合和易于使用的经过训练的模型中,包括使用9种基于不同基因学的图像适应性网络结构,在4个域的11个数据集中(即: 乳房模型、 精度 精度矩阵、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 深度分析、 系统分析、 系统分析、 系统分析 、 系统分析 、 分析 、 分析 分析、 分析、 系统分析、 分析 分析 分析、 分析 分析 分析 分析 分析、 分析、 、 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 系统分析 、 、 、 、 、 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 分析 和 分析 分析 分析 分析 分析 分析