项目名称: TRPM2通道结构与功能及其与新型通道阻断剂相互作用的研究

项目编号: No.31471118

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2015

项目学科: 生物科学

项目作者: 江林华

作者单位: 新乡医学院

项目金额: 86万元

中文摘要: TRPM2是ADPR门控瞬时受体电位通道,可被活性氧激活,被认作是一种新型氧化应激感受器。利用基因敲除小鼠,揭示TRPM2在缺血再灌注损伤、神经退行性病变、炎症等过程中发挥关键作用;因此 TRPM2作为新型药物靶点已引起国际制药行业极大兴趣。TRPM2通道是同源四聚物,每个亚基包含6个跨膜片段(S1-S6)和S5-S6之间的P环。P环和S5、S6胞外端 构成通道胞外孔区。胞外孔区既是决定通道特殊功能的关键结构区域,又是药物最易结合的位点。目前对TRPM2胞外孔区知之甚少。本研究利用刚解析的TRPV1通道结构及其与TRPM2氨基酸序列的保守性构建TRPM2通道结构模型。结合定点突变和交联技术与膜片钳技术验证胞外孔区结构模型,并通过解析两种不同的新型通道阻断剂的结合位点来确认和完善TRPM2胞外孔区结构。阐明TRPM2通道结构和功能关系为理解其生理功能、相关发病机制和药物研制所需信息奠定基础。

中文关键词: TRPM2瞬时受体电位通道孔;通道阻断剂;结构模拟;定点突变;胞外孔区

英文摘要: TRPM2 is a Ca2+-permeable cationic channel gated by intracellular ADP-ribose (ADPR) and, due to its potent activation by reactive oxygen species (ROS), has been shown in recent studies to play an important role in ischemia/reperfusion-induced neurodegeneration and heart infarction, diabetes and inflammatory diseases. Such studies highlight TRPM2 channel inhibition as a promising novel therapeutic strategy. This proposal will study the extracellular pore, or the extracellular vestibule of the transmembrane ion-permeating pore in the human TRPM2 (hTRPM2) channel. The extracellular pore is the key structural module that determines the channel functional properties, and it is also readily accessible from extracellular side; these unique attributes make the extracellular pore as an appealing site for drug targeting.Furthermore, the hTRPM2 extracellular pore is the target of naturally occurring mutation associated with diseases. We aim to delineate the extracellular pore, using three independent and complementary approaches. First, we will compute structural models of the hTRPM2 pore in the closed and open states. The recently available TRPV1 pore structures and strong sequence relatedness in the key pore-forming parts between TRPV1 and TRPM2 provide us an unprecedented opportunity to generate meaningful models of the hTRPM2 pore. Second, using substituted cysteine accessibility and cysteine-based cross-linking methods, we will obtain experimental data to corroborate and refine the structural models of the hTRPM2 extracellular pore. Finally, we will study the interactions of two structurally different TRPM2 open channel blockers with the extracellular pore to identify the interacting residues that are accessible in the open but not closed state. Identification of such extracellular pore residues will provide independent evidence to elaborate the structural models of the hTRPM2 extracellular pore. The structure-function relationship information of the hTRPM2 extracellular pore gleaned from this project will enable us to gain a mechanistic insight into TRPM2 channel activation, offer a better understanding of the disease mechanisms and provide highly desirable knowledge for the expanding efforts of developing small molecular chemicals as TRPM2 channel blockers for therapeutic use.

英文关键词: TRPM2 channel pore;Open channel blockers;Structural modeling;Site-directed mutagenesis;Extracellular pore

成为VIP会员查看完整内容
0

相关内容

NeurIPS 2021 | 通过动态图评分匹配预测分子构象
专知会员服务
21+阅读 · 2021年12月4日
专知会员服务
27+阅读 · 2021年10月6日
最新「图机器学习药物发现」综述论文,22页pdf245篇文献
【WWW2021】张量时间序列网络
专知会员服务
43+阅读 · 2021年4月20日
【博士论文】解耦合的类脑计算系统栈设计
专知会员服务
30+阅读 · 2020年12月14日
KDD20 | AM-GCN:自适应多通道图卷积网络
专知会员服务
39+阅读 · 2020年8月26日
【KDD2020】自适应多通道图卷积神经网络
专知会员服务
119+阅读 · 2020年7月9日
【学科交叉】抗生素发现的深度学习方法
专知会员服务
23+阅读 · 2020年2月23日
深度学习预测蛋白质-蛋白质相互作用
机器之心
5+阅读 · 2022年1月15日
你最讨厌哪个 App 功能?
ZEALER订阅号
1+阅读 · 2021年12月4日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Arxiv
30+阅读 · 2021年7月7日
Deep Reinforcement Learning: An Overview
Arxiv
17+阅读 · 2018年11月26日
小贴士
相关主题
相关VIP内容
NeurIPS 2021 | 通过动态图评分匹配预测分子构象
专知会员服务
21+阅读 · 2021年12月4日
专知会员服务
27+阅读 · 2021年10月6日
最新「图机器学习药物发现」综述论文,22页pdf245篇文献
【WWW2021】张量时间序列网络
专知会员服务
43+阅读 · 2021年4月20日
【博士论文】解耦合的类脑计算系统栈设计
专知会员服务
30+阅读 · 2020年12月14日
KDD20 | AM-GCN:自适应多通道图卷积网络
专知会员服务
39+阅读 · 2020年8月26日
【KDD2020】自适应多通道图卷积神经网络
专知会员服务
119+阅读 · 2020年7月9日
【学科交叉】抗生素发现的深度学习方法
专知会员服务
23+阅读 · 2020年2月23日
相关资讯
深度学习预测蛋白质-蛋白质相互作用
机器之心
5+阅读 · 2022年1月15日
你最讨厌哪个 App 功能?
ZEALER订阅号
1+阅读 · 2021年12月4日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
微信扫码咨询专知VIP会员