项目名称: 钠钾离子通道的结构功能关联和选择性离子传导机制研究
项目编号: No.30970557
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 郭万林
作者单位: 南京航空航天大学
项目金额: 30万元
中文摘要: 50多年前人们就揭示出钠、钾离子被动跨膜传输是神经信号的物理基础。1998年获得第一个钾离子通道KcsA蛋白质结构掀起了基于原子级结构探索离子选择性导通机制的热潮,但主要成果限于钾离子通道。2006年第一个可同时导通钾、钠离子的NaK通道的闭式结构被报道,本课题组立即开展其结构-功能关联研究并发现一种新的水合阀控制离子导通的机制。09年初NaK通道的开式结构又获报道,高分辨的结构数据支持我们发现的水合阀的存在。本项目将以NaK通道结构为基础,通过全原子分子动力学模拟,运用拉伸分子动力学、自由能分析和生物信息学等交叉学科方法,系统研究NaK通道中钠、钾离子在水合作用下的稳定排布和选择性导通机制、开闭机制,揭示钾通道之外的离子导通机制和水合机制。进而对CNG通道的结构和导通机制进行同源建模研究,探索水合动力学机制在整个钠、钾离子通道家族中的深层作用。
中文关键词: 钠钾离子通道;离子导通;分子动力学;自由能;
英文摘要:
英文关键词: NaK channel;ion conduction;molecular dynamics;free energy;