项目名称: 人类基因的可变剪接及其与人类疾病关系的研究
项目编号: No.60963015
项目类型: 地区科学基金项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 金属学与金属工艺
项目作者: 张利绒
作者单位: 内蒙古大学
项目金额: 20万元
中文摘要: 在已有的人、鼠、牛、线虫、拟南芥等物种的可变剪接数据库的基础上,进一步完善疾病有关的、组织特异的可变剪接数据库等各类子库。在此基础上,完善我们在剪接位点识别问题中所提出的IDQD方法,根据mRNA剪接位点的保守性特征,发展剪接位点识别的新途径,进一步提高预测可变剪接位点的能力;对不同模式可变剪接的内含子长度、特征、结构,剪接位点附近序列的保守性进行信息学分析,统计分析可变剪接与物种进化的关联,在此基础上研究可变剪接的调节机制;进行癌症特异的剪接变体和正常剪接体的剪接位点及其调控序列的信息学分析,从而发现与乳腺癌、肺癌、肝癌等癌变相关的剪接变异体模式的特点,揭示其与肿瘤发生的关系,及在不同肿瘤中的表达特征和功能意义;系统解码可移动元素在mRNA可变剪接调控中的作用,进行可变剪接与可移动元素相关联的信息学分析,解析可移动元素与可变剪接之间的相互作用关系。
中文关键词: 可变剪接;核小体定位;组蛋白修饰;Alu序列;前体miRNA
英文摘要:
英文关键词: alternative splicing;nucleosome positioning;histone modification;Alu sequence;pre-miRNA