项目名称: 啤酒花矮化类病毒不同变体致病性差异的分子机制研究
项目编号: No.31401714
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 农业科学
项目作者: 张志想
作者单位: 中国农业科学院植物保护研究所
项目金额: 26万元
中文摘要: 类病毒是一类非编码、环状RNA 分子。它侵染寄主植物,通过影响寄主的基因表达而引发病症。目前,对该机制仍不清楚。本课题以致病性不同的两个啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid, HSVd)的变体HSVd-g和HSVd-h为材料,通过研究它们的致病性差异来揭示类病毒的致病机制。首先,利用定点突变技术,系统分析HSVd基因组中碱基的改变对其致病性的影响,从而确认决定HSVd致病性的碱基位点。其次,对感染这两个变体的黄瓜样品进行转录组分析,获得转录组数据库,比较这两个数据库中基因的种类和表达量,筛选出差异表达的黄瓜基因。另外,建立代谢组数据库,比较感染这两个变体的黄瓜体内的次级代谢产物的种类及含量,鉴定差异的次级代谢产物,并且分析它们所参与的代谢路径。研究结果不仅能够明确HSVd不同变体致病性差异的分子机制,而且有助于进一步理解类病毒的致病机制。
中文关键词: 类病毒;基因沉默;转录组;代谢组;
英文摘要: Viroids are nocoding, circular RNAs that can enter plant cells and establish systemic infection, causing severe disease symptoms via regulation of host gene expression. Molecular mechanism of viroid pathogenesis is still largely unknown. The purpose of th
英文关键词: viroid;gene silencing;transcriptome;metabolomics;