Graves'病关联区域候选基因深度测序及致病变异的鉴定

项目名称： Graves'病关联区域候选基因深度测序及致病变异的鉴定

项目编号： No.31171222

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 遗传学与生物信息学、细胞生物学

项目作者： 黄薇

作者单位： 上海人类基因组研究中心

项目金额： 70万元

中文摘要： Graves'病(GD)是一种遗传与环境共同起作用导致的器官特异性自身免疫性疾病。课题组前期完成了中国人群GD 的全基因组关联研究(GWAS)，结果验证了报道的四个关联区域，并发现和验证三个新的关联区域。然而，这些覆盖着多个易感基因的关联区域由于存在着强的连锁不平衡，目前的数据不能判定真正的易感基因；另外，已发现的这些常见变异只能对GD遗传机制的一小部分做出解释，未被发现的罕见变异可能对GD的易感性也起到重要的作用。新一代测序技术的发展，使得鉴定这些易感区域内的致病基因和探讨罕见变异对常见疾病的影响成为可能。本课题拟利用新一代的测序技术454 GS FLX系统，在病例对照样本中对GWAS发现的易感区域内的候选基因进行深度测序，并对发现的变异进行关联分析；阳性结果在独立的大样本中进行验证，鉴定易感基因和变异；利用生物信息学和分子生物学手段，阐述疾病相关的遗传变异影响疾病发生的生物学机制。

中文关键词： Graves'病；罕见变异；新一代测序技术；关联研究；候选基因

英文摘要：

英文关键词： Graves’ disease；rare variants；next generation sequencing technology；association study；candiate genes