项目名称: microRNA在根结线虫寄生发育中的调控网络研究
项目编号: No.30900925
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 金属学与金属工艺
项目作者: 王运生
作者单位: 湖南农业大学
项目金额: 21万元
中文摘要: 根结线虫是世界上为害最严重的线虫种群之一,对花生、蔬菜生产造成巨大损失。microRNAs(miRNA)是一类普遍存在于真核生物中的重要调控因子,其本身及其靶标基因均具作为药物靶标潜力。本项目基于根结线虫小片段RNA深度测序及其全基因组序列,利用生物信息学方法从基因组水平上发掘根结线虫miRNA,用Northern杂交和qRT-PCR方法鉴定与根结线虫寄生发育相关的miRNA,在此基础上结合根结线虫全基因组基因注释结果和EST数据,预测miRNA调控的靶基因,构建根结线虫miRNA在寄生发育中的调控网络,以miRNA为锚定引物进行RT-PCR,克隆与鉴定重要靶基因并研究其时空表达模式和作用方式,探索miRNA在调控根结线虫寄生发育过程中的作用机理,为解析根结线虫致病机理提供理论依据,为抗根结线虫分子育种提供新的转基因靶标。
中文关键词: 南方根结线虫;微小RNA;高通量测序;毒性变异;
英文摘要:
英文关键词: Meloidogyne incognita;microRNA;high throughput sequencing;virulent variation;