项目名称: 栉孔扇贝应答高温胁迫的关键基因及其共表达网络分析
项目编号: No.31172384
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 畜牧学与草地科学、兽医学、水产学
项目作者: 张玲玲
作者单位: 中国海洋大学
项目金额: 62万元
中文摘要: 高温被认为是引发栉孔扇贝夏季大规模死亡的主要诱因。高温影响生物体诸多生理功能的正常行使,许多参与生长、代谢、免疫等生理过程的基因在高温胁迫下表达量均出现显著差异。深入理解这些基因之间的相互作用关系,并从中鉴别出生物体应答高温胁迫的关键基因,是深入研究生物体高温耐受分子调控机理的重要基础。本研究应用权重基因共表达网络分析法探讨栉孔扇贝应答高温胁迫的基因网络响应机制。主要研究内容包括:对扇贝高温胁迫前后进行基因表达定量分析,鉴别高温胁迫相关差异基因;利用WGCNA法构建基因共表达网络,鉴别并注释基因模块;寻找与高温胁迫相关的基因模块,鉴别模块内的关键调控基因,并进行eQTL分析;寻找栉孔扇贝进化上保守的基因模块和关键基因。本研究将有助于从分子水平理解栉孔扇贝夏季大规模死亡的成因,为耐高温新品种的培育提供参考,也将为其它海洋生物基因网络研究提供可借鉴的成功范例。
中文关键词: 栉孔扇贝;基础耐热;获得性耐热;基因共表达网络;WGCNA
英文摘要:
英文关键词: Chlamys farreri;basal thermotolerance;acquired thermotolerance;gene coexpression network;WGCNA