基于超高通量测序的荔枝胚败育分子调控网络研究及其功能标记开发

项目名称： 基于超高通量测序的荔枝胚败育分子调控网络研究及其功能标记开发

项目编号： No.30900980

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 武器工业

项目作者： 孙清明

作者单位： 广东省农业科学院

项目金额： 20万元

中文摘要： 荔枝胚胎败育引起的焦核突变是一种优良的果实性状变异，具有极高的育种及经济价值。阐明其形成的分子机制在理论和实践上具有重要意义。本项目拟分两步进行：（1）分别以大核品种"怀枝"和焦核品种"糯米糍"的双授精后胚珠不同发育时期的混合RNA样品为材料，利用超高通量测序系统GS FLX进行测序，较全面地获得胚珠正常发育基因表达谱和胚珠败育基因表达谱，利用生物信息学的方法，获得胚珠育性差异基因表达谱，并对差异基因进行验证，从整体水平解析胚败育产生荔枝焦核化的分子调控网络；（2）从胚珠育性差异表达谱中大规模开发EST-SSR和EST-SNP，利用关联分析验证其功能，确定影响荔枝胚败育重要相关基因及其功能标记。项目的实施为阐明焦核荔枝形成的分子机制、培育焦核或无核优质荔枝新品种提供依据，为荔枝新基因发掘、遗传图谱构建、分子标记辅助选择、种质资源的创新利用奠定基础。

中文关键词： 荔枝；胚珠败育；测序；分子调控网络；分子标记

英文摘要：

英文关键词： litchi；embryo abortion；sequencing；molecular regulationary networ；molecular marker