整合组学数据构建基因功能连锁网络，预测肺癌候选基因

项目名称： 整合组学数据构建基因功能连锁网络，预测肺癌候选基因

项目编号： No.30971643

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 田卫东

作者单位： 复旦大学

项目金额： 28万元

中文摘要： 肺癌是全球死亡率最高的癌症。肺癌早期诊断困难，80%肺癌患者就诊时已属晚期。要提高肺癌早期诊断率的一种重要途径就是鉴定肺癌早期的生物分子标志。尽管一些重要的肺癌相关基因已被发现，很多和肺癌相关的基因还未被实验鉴定，限制了鉴定肺癌早期诊断生物标志的努力。现代高通量技术手段的快速发展已积累了大量的组学数据，为鉴定肺癌相关基因的研究提供了崭新的机遇。为加速肺癌相关基因的鉴定及促进肺癌分子机制的研究，本课题计划通过生物信息学方法整合人基因组组学数据预测基因功能并构建基因功能连锁网络，从中鉴定富集肺癌已知基因的基因模块，进而预测和已知肺癌基因功能紧密相关的肺癌候选基因,并对其进行功能分析和在不同种类肺癌细胞中基因表达水平的研究。本课题的研究成果将为鉴定肺癌基因及肺癌早期诊断生物标志的研究工作提供一新的思路。对不同种类肺癌基因及其候选基因的功能分析结果也将为肺癌的分子机制的研究提供新的认识。

中文关键词： 癌症标志物；生物信息学 ；生物网络；基因模块；通路分析

英文摘要：

英文关键词： cancer biomarker；bioinformatics ；biological network；gene module；pathway analysis