基于高通量RNA测序技术的肝癌特异lncRNA表达谱及调控网络研究

项目名称： 基于高通量RNA测序技术的肝癌特异lncRNA表达谱及调控网络研究

项目编号： No.31401144

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 姚坚

作者单位： 浙江大学

项目金额： 25万元

中文摘要： 最近研究显示：长链非编码RNA（lncRNA）在包括肝癌在内的多种肿瘤中异常表达，且与肿瘤的发生、发展密切相关。本课题拟利用第二代高通量测序技术，采用去rRNA的纯化策略，对肝细胞肝癌组织进行全转录组RNA测序，以获得肝癌特异lncRNA表达谱；同时，结合相关临床资料，建立与肝癌诊断及预后相关联的lncRNA预测模型；其次，对比分析差异lncRNA与编码基因表达谱，构建lncRNA-基因互作网络调控图；最后，筛选出肝癌特异性lncRNA，检测其对肝癌细胞细胞周期、增殖能力、侵袭转移能力的作用，以明确lncRNA在肝癌发生发展进展中的作用。该研究的开展，将从另一个层面更系统全面地揭示肝细胞肝癌特异的lncRNA表达谱，并通过lncRNA-基因表达互作网络调控图及lncRNA的生物学功能研究，更深入揭示lncRNA与编码基因的分子作用机制，为肝癌的早期诊断、治疗及预后分析提供新的策略。

中文关键词： 长链非编码RNA；肝癌；共表达调控网络；RNA测序；二代测序

英文摘要： Recently, accumulating articles have reported that long non-coding RNAs (lncRNAs) are aberrantly expressed in many cancers, including hepatocellular carcinoma (HCC). And lncRNA expression profiles are correlated with tumorigenesis, and progression. In thi

英文关键词： long non-coding RNA；hepatocellular carcinoma；co-expression regulatory network；RNA-sequencing；next-generation sequencing