项目名称: 胡杨应答盐胁迫转录组测序分析及基因表达调控网络的构建
项目编号: No.31401138
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 司婧娜
作者单位: 北京林业大学
项目金额: 22万元
中文摘要: 土壤盐渍化是影响植物生长发育、降低作物产量、甚至危及生态环境的主要逆境因素之一。深入研究植物尤其是典型植物的耐盐机制,对指导农林作物的遗传改良具有重要意义。胡杨(Populus euphratica)是我国西北干旱盐碱地带唯一能形成森林的高大乔木树种,是进行木本植物耐盐研究的典型材料。项目根据国内外胡杨生理的研究基础,采用盐处理和对照胡杨扦插无性系为材料,确定取样的关键时期与组织部位,利用RNA-seq测序和基因芯片技术,构建具有时间和空间代表性的盐胁迫胡杨转录组文库。通过不同部位对不同盐处理时间点响应的基因表达情况的综合分析,比较深入理解胡杨不同部位对盐胁迫响应的特点,找出胡杨耐盐性的关键基因和蛋白。充分利用生物信息学技术和公共数据库资源,构建胡杨应答盐胁迫的基因表达调控网络,获得胡杨抗逆相关基因的序列特征和功能定位,为胡杨的遗传改良提供基因资源,为解析胡杨耐盐的分子机制提供重要参考。
中文关键词: 胡杨;盐胁迫;转录组;基因表达;调控网络
英文摘要: Soil salinity is one of the most important factors to effect plant growth and development, decrease crop production, even endanger the ecological environment. Intensive study of salt tolerance mechanism of typical plant is very necessary to guide agricult
英文关键词: Populus euphratica;salt stress;transcription;gene expression;regulatory network