基于环境转录组分析的红树林湿地微生物群落对典型有机物污染的响应机制研究

项目名称： 基于环境转录组分析的红树林湿地微生物群落对典型有机物污染的响应机制研究

项目编号： No.41176093

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 天文学、地球科学

项目作者： 田蕴

作者单位： 厦门大学

项目金额： 71万元

中文摘要： 以福建漳江口红树林湿地为研究区域，红树林湿地微生物群落为研究对象，在前期环境基因组研究的基础上，引入环境转录组的研究方法，借助新一代测序技术高通量、低成本、高质量的优势，扩大测序样本量；并通过基因功能注释、差异表达分析、蛋白功能和分类预测等生物信息分析手段，研究暴露和未暴露于多环芳烃（PAHs）污染下的红树林湿地微生物，包括未培养微生物在内的整个群落的集体转录组。分析红树林湿地微生物群落在物种水平、基因表达水平以及代谢功能水平上对典型有机物污染的响应机制，发掘新物种、新功能基因并探究其与关键的生物地球化学过程的关联，揭示红树林湿地微生物的环境功能与作用规律。本项目的实施将为在同一环境样本中同时分析、评价和预测微生物群落的结构和功能提供一个全新的视角；为全面认识环境微生物群体水平的生理功能并用最新的生物技术手段来监测海洋环境和治理污染的研究拉开序幕。

中文关键词： 红树林湿地；微生物群落；宏转录组；多环芳烃；响应机制

英文摘要：

英文关键词： mangrove sediment；microbial communities；metatranscriptomics；Polycyclic aromatic hydrocarbon；response mechanism