海参自溶动态基因表达调控网络的构建

项目名称： 海参自溶动态基因表达调控网络的构建

项目编号： No.31370037

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 吴海涛

作者单位： 大连工业大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 海参具有极强的自溶能力，这给海参的保鲜、贮藏、运输和加工带来诸多不便。前期的青年科学基金项目从基因表达水平出发，明确了组织蛋白酶L对海参自溶的调控方式及靶点蛋白的生物信息。此外，研究还发现，海参自溶过程涉及多种基因表达的改变，这为研究海参自溶机理提供了新的线索，又带来了新的科学问题——海参自溶关键功能基因有哪些？各关键功能基因间有何联系？因此，针对这两个问题，本项目拟从转录水平上研究海参自溶过程。首先，利用分子生物学手段构建海参自溶动态转录组文库，应用Roche454测序技术，结合生物信息学分析软件，对差异表达基因进行功能注释、聚类及富集分析，获得候选功能基因；其次，对候选基因进行相似性、同源性分析，并进行表达验证与筛选，获得关键功能基因。最后，利用KEGG数据库，对关键功能基因进行信号通路富集显著性及相互作用分析，构建海参自溶动态基因表达调控网络，为揭示海参自溶机理奠定研究基础。

中文关键词： 海参；自溶；转录组；基因表达；机理

英文摘要： Sea cucumber (Stichopus japonicus) possesses strong ability of autolysis, which leads to severe deterioration in its quality during preservation, storage, transport and handling. Our previous studies supported by National Natural Science Foundation of Chi

英文关键词： Sea cucumber；Autolysis；Transcriptome；Gene expression；Mechanism