建立新的生物信息学方法鉴定流行性乙型脑炎病毒的重要功能位点

项目名称： 建立新的生物信息学方法鉴定流行性乙型脑炎病毒的重要功能位点

项目编号： No.81371810

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 医药、卫生

项目作者： Simon Rayner

作者单位： 中国科学院武汉病毒研究所

项目金额： 70万元

中文摘要： 常规的传染性疾病监测措施在掌握疾病的早期流行状况、预防疾病爆发流行，保护人民健康的过程中发挥了重要作用。但是随着人口的频繁流动，自然和社会环境的快速变化，常规的监测措施已经难以对许多新发和再发传染性疾病进行有效控制。本课题将以流行性乙型脑炎病毒为研究对象，一方面整合监测数据、毒株背景信息和蛋白结构等信息，对系统进化树进行结构分析，筛选在病毒生命周期和毒力决定中起关键作用的核苷酸和氨基酸突变位点，分析其在病毒进化中的作用。另一方面整合多重数据源、开发新算法和软件工具，研究深入挖掘病毒基因变异和进化规律的新方法，阐明病毒流行和进化的机制。然后结合实验手段，筛选并验证流行性乙型脑炎病毒序列中的功能性位点。本课题的成功实施，将为流行性乙型脑炎病毒的研究工作提供一个整合的、深入了解病毒感染和传播机制的研究平台，极大地促进流行病学、疫苗开发等方面的工作；同时也为其他病毒性流行病的研究打下良好的基础。

中文关键词： 流行性乙型脑炎病毒；数据挖掘；生物信息分析；功能位点预测；

英文摘要： Emerging and infectious diseases represent an ongoing threat to the health and economic well-being of every country. Surveillance programs involving sample isolation and recording clinical data are a common way to investigate the seriousness of these thre

英文关键词： Japanese Encephalitis Virus；Data mining；Bioinformatics analysis；Prediction of functional sites；