时间序列深度学习:状态 LSTM 模型预测太阳黑子(中)

2018 年 6 月 15 日 R语言中文社区

作者:徐瑞龙 整理分享量化投资与固定收益相关的文章

博客专栏: 

https://www.cnblogs.com/xuruilong100 



5 用 Keras 构建状态 LSTM 模型

首先,我们将在回测策略的某个样本上用 Keras 开发一个状态 LSTM 模型。然后,我们将模型套用到所有样本,以测试和验证模型性能。

5.1 单个 LSTM 模型

对单个 LSTM 模型,我们选择并可视化最近一期的分割样本(Slice11),这一样本包含了最新的数据。

split    <- rolling_origin_resamples$splits[[11]] split_id <- rolling_origin_resamples$id[[11]]

5.1.1 可视化该分割样本

我么可以用 plot_split() 函数可视化该分割,设定 expand_y_axis = FALSE 以便将横坐标缩放到样本本身的范围。

plot_split(    split,
   expand_y_axis = FALSE,    
   size = 0.5) +    
   theme(legend.position = "bottom") +    
   ggtitle(glue("Split: {split_id}"))

5.1.2 数据准备

首先,我们将训练和测试数据集合成一个数据集,并使用列 key 来标记它们来自哪个集合(training 或 testing)。请注意,tbl_time 对象需要在调用 bind_rows() 时重新指定索引,但是这个问题应该很快在 dplyr 包中得到纠正。

df_trn <- training(split) df_tst <- testing(split) df <- bind_rows(    df_trn %>% add_column(key = "training"),    df_tst %>% add_column(key = "testing")) %>%
    as_tbl_time(index = index) df


## # A time tibble: 720 x 3
## # Index: index
##    index      value key    
##    <date>     <dbl> <chr>  
##  1 1949-11-01 144.  training
##  2 1949-12-01 118.  training
##  3 1950-01-01 102.  training
##  4 1950-02-01  94.8 training
##  5 1950-03-01 110.  training
##  6 1950-04-01 113.  training
##  7 1950-05-01 106.  training
##  8 1950-06-01  83.6 training
##  9 1950-07-01  91.0 training
## 10 1950-08-01  85.2 training
## # ... with 710 more rows
5.1.3 用 recipe 做数据预处理

LSTM 算法要求输入数据经过中心化并标度化。我们可以使用 recipe 包预处理数据。我们用 step_sqrt 来转换数据以减少异常值的影响,再结合 step_center 和 step_scale 对数据进行中心化和标度化。最后,数据使用 bake() 函数实现处理转换。

rec_obj <- recipe(value ~ ., df) %>%
   step_sqrt(value) %>%    
   step_center(value) %>%    
   step_scale(value) %>%    
   prep() df_processed_tbl <- bake(rec_obj, df) df_processed_tbl


## # A tibble: 720 x 3
##    index      value key    
##    <date>     <dbl> <fct>  
##  1 1949-11-01 1.25  training
##  2 1949-12-01 0.929 training
##  3 1950-01-01 0.714 training
##  4 1950-02-01 0.617 training
##  5 1950-03-01 0.825 training
##  6 1950-04-01 0.874 training
##  7 1950-05-01 0.777 training
##  8 1950-06-01 0.450 training
##  9 1950-07-01 0.561 training
## 10 1950-08-01 0.474 training
## # ... with 710 more rows

接着,记录中心化和标度化的信息,以便在建模完成之后可以将数据逆向转换回去。平方根转换可以通过乘方运算逆转回去,但要在逆转中心化和标度化之后。

center_history <- rec_obj$steps[[2]]$means["value"] scale_history  <- rec_obj$steps[[3]]$sds["value"]

c("center" = center_history, "scale" = scale_history)


## center.value  scale.value
##     7.549526     3.545561
5.1.4 规划 LSTM 模型

我们需要规划下如何构建 LSTM 模型。首先,了解几个 LSTM 模型的专业术语

张量格式(Tensor Format)

  • 预测变量(X)必须是一个 3 维数组,维度分别是:samplestimesteps 和 features。第一维代表变量的长度;第二维是时间步(滞后阶数);第三维是预测变量的个数(1 表示单变量,n 表示多变量)

  • 输出或目标变量(y)必须是一个 2 维数组,维度分别是:samples 和 timesteps。第一维代表变量的长度;第二维是时间步(之后阶数)

训练与测试

  • 训练与测试的长度必须是可分的(训练集长度除以测试集长度必须是一个整数)

批量大小(Batch Size)

  • 批量大小是在 RNN 权重更新之前一次前向 / 后向传播过程中训练样本的数量

  • 批量大小关于训练集和测试集长度必须是可分的(训练集长度除以批量大小,以及测试集长度除以批量大小必须是一个整数)

时间步(Time Steps):

  • 时间步是训练集与测试集中的滞后阶数

  • 我们的例子中滞后 1 阶

周期(Epochs)

  • 周期是前向 / 后向传播迭代的总次数

  • 通常情况下周期越多,模型表现越好,直到验证集上的精确度或损失不再增加,这时便出现过度拟合

考虑到这一点,我们可以提出一个计划。我们将预测窗口或测试集的长度定在 120 个月(10年)。最优相关性发生在 125 阶,但这并不能被预测范围整除。我们可以增加预测范围,但是这仅提供了自相关性的最小幅度增加。我们选择批量大小为 40,它可以整除测试集和训练集的观察个数。我们选择时间步等于 1,这是因为我们只使用 1 阶滞后(只向前预测一步)。最后,我们设置 epochs = 300,但这需要调整以平衡偏差与方差。

# Model inputs
lag_setting  <- 120 # = nrow(df_tst)
batch_size   <- 40

train_length <- 440
tsteps       <- 1
epochs       <- 300

5.1.5 2 维与 3 维的训练、测试数组

下面将训练集和测试集数据转换成合适的形式(数组)。记住,LSTM 模型要求预测变量(X)是 3 维的,输出或目标变量(y)是 2 维的。

# Training Set
lag_train_tbl <- df_processed_tbl %>%

   mutate(value_lag = lag(value, n = lag_setting)) %>%    
   filter(!is.na(value_lag)) %>%    
   filter(key =="training") %>%    
   tail(train_length) x_train_vec <- lag_train_tbl$value_lag x_train_arr <- array(
       data = x_train_vec, dim = c(length(x_train_vec), 1, 1)) y_train_vec <- lag_train_tbl$value y_train_arr <- array(
           data = y_train_vec, dim = c(length(y_train_vec), 1))

# Testing Set
lag_test_tbl <- df_processed_tbl %>%

   mutate(
           value_lag = lag(                value, n = lag_setting)) %>%    
   filter(!is.na(value_lag)) %>%    
   filter(key =="testing") x_test_vec <- lag_test_tbl$value_lag x_test_arr <- array(
       data = x_test_vec,    
       dim = c(length(x_test_vec), 1, 1)) y_test_vec <- lag_test_tbl$value y_test_arr <- array(
           data = y_test_vec,    
           dim = c(length(y_test_vec), 1))

5.1.6 构建 LSTM 模型

我们可以使用 keras_model_sequential() 构建 LSTM 模型,并像堆砖块一样堆叠神经网络层。我们将使用两个 LSTM 层,每层都设定 units = 50。第一个 LSTM 层接收所需的输入形状,即[时间步,特征数量]。批量大小就是我们的批量大小。我们将第一层设置为 return_sequences = TRUE 和 stateful = TRUE。第二层和前面相同,除了 batch_sizebatch_size只需要在第一层中指定),另外 return_sequences = FALSE 不返回时间戳维度(从第一个 LSTM 层返回 2 维数组,而不是 3 维)。我们使用 layer_dense(units = 1),这是 Keras 序列模型的标准结尾。最后,我们在 compile() 中使用 loss ="mae" 以及流行的 optimizer = "adam"

model <- keras_model_sequential()

model %>%

   layer_lstm(
           units            = 50,       
           input_shape      = c(tsteps, 1),         
           batch_size       = batch_size,        
           return_sequences = TRUE,         
           stateful         = TRUE) %>%     
   layer_lstm(
           units            = 50,         
           return_sequences = FALSE,                    
           stateful         = TRUE) %>%     
   layer_dense(units = 1) model %>%
        compile(loss = 'mae', optimizer = 'adam') model


## Model
## ______________________________________________________________________
## Layer (type)                   Output Shape                Param #    
## ======================================================================
## lstm_1 (LSTM)                  (40, 1, 50)                 10400      
## ______________________________________________________________________
## lstm_2 (LSTM)                  (40, 50)                    20200      
## ______________________________________________________________________
## dense_1 (Dense)                (40, 1)                     51        
## ======================================================================
## Total params: 30,651
## Trainable params: 30,651
## Non-trainable params: 0
## ______________________________________________________________________
5.1.7 拟合 LSTM 模型

下一步,我们使用一个 for 循环拟合状态 LSTM 模型(需要手动重置状态)。有 300 个周期要循环,运行需要一点时间。我们设置 shuffle = FALSE 来保存序列,并且我们使用 reset_states() 在每个循环后手动重置状态。

for (i in 1:epochs) {    model %>%
       fit(x          = x_train_arr,            y          = y_train_arr,            batch_size = batch_size,            
           epochs     = 1,            verbose    = 1,            shuffle    = FALSE)        model %>% reset_states()    
   cat("Epoch: ", i) }

5.1.8 使用 LSTM 模型预测

然后,我们可以使用 predict() 函数对测试集 x_test_arr 进行预测。我们可以使用之前保存的 scale_history 和 center_history 转换得到的预测,然后对结果进行平方。最后,我们使用 reduce() 和自定义的 time_bind_rows() 函数将预测与一列原始数据结合起来。

# Make Predictions
pred_out <- model %>%

    predict(x_test_arr, batch_size = batch_size) %>%    .[,1] # Retransform values
pred_tbl <- tibble(

        index   = lag_test_tbl$index,    
        value   = (pred_out * scale_history + center_history)^2) # Combine actual data with predictions
tbl_1 <- df_trn %>%

            add_column(key = "actual") tbl_2 <- df_tst %>%
                add_column(key = "actual") tbl_3 <- pred_tbl %>%
                    add_column(key = "predict")

# Create time_bind_rows() to solve dplyr issue
time_bind_rows <- function(data_1,                           data_2, index) {    index_expr <- enquo(index)

   bind_rows(data_1, data_2) %>%
           as_tbl_time(index = !! index_expr) } ret <- list(tbl_1, tbl_2, tbl_3) %>%
               reduce(time_bind_rows, index = index) %>%    
               arrange(key, index) %>%    
               mutate(key = as_factor(key)) ret


## # A time tibble: 840 x 3
## # Index: index
##    index      value key  
##    <date>     <dbl> <fct>
##  1 1949-11-01 144.  actual
##  2 1949-12-01 118.  actual
##  3 1950-01-01 102.  actual
##  4 1950-02-01  94.8 actual
##  5 1950-03-01 110.  actual
##  6 1950-04-01 113.  actual
##  7 1950-05-01 106.  actual
##  8 1950-06-01  83.6 actual
##  9 1950-07-01  91.0 actual
## 10 1950-08-01  85.2 actual
## # ... with 830 more rows

5.1.9 评估单个分割样本上 LSTM 模型的表现

我们使用 yardstick 包里的 rmse() 函数评估表现,rmse() 返回均方误差平方根(RMSE)。我们的数据以“长”格式的形式存在(使用 ggplot2 可视化的最佳格式),所以需要创建一个包装器函数 calc_rmse() 对数据做预处理,以适应 yardstick::rmse() 的要求。

calc_rmse <- function(prediction_tbl) {        rmse_calculation <- function(data) {        data %>%
           spread(key = key, value = value) %>%            
           select(-index) %>%            
           filter(!is.na(predict)) %>%            
           rename(
                           truth    = actual,                
                           estimate = predict) %>%            
                           rmse(truth, estimate)    }        safe_rmse <- possibly(        rmse_calculation, otherwise = NA)
                                   safe_rmse(prediction_tbl) }

我们计算模型的 RMSE。

calc_rmse(ret)


## [1] 31.81798

RMSE 提供的信息有限,我们需要可视化。注意:当我们扩展到回测策略中的所有样本时,RMSE 将在确定预期误差时派上用场。

5.1.10 可视化一步预测

下一步,我们创建一个绘图函数——plot_prediction(),借助 ggplot2 可视化单一样本上的结果。

# Setup single plot function

plot_prediction <- function(data, 

                                             id,                            
                                            alpha = 1,                            
                                            size = 2,                            
                                            base_size = 14) {

        rmse_val <- calc_rmse(data)


        g <- data %>%        
            ggplot(aes(index, value, color = key)) +        
            geom_point(alpha = alpha, size = size) +         
            theme_tq(base_size = base_size) +        
            scale_color_tq() +        
            theme(legend.position = "none") +        
            labs(
                    title = glue(
                          "{id}, RMSE: {round(rmse_val, digits = 1)}"),            
                    x = "", y = "")

        return(g) }

我们设置 id = split_id,在 Slice11 上测试函数。

ret %>%
    plot_prediction(id = split_id, alpha = 0.65) +
    theme(legend.position = "bottom")

LSTM 模型表现相对较好! 我们选择的设置似乎产生了一个不错的模型,可以捕捉到数据中的趋势。预测在下一个上升趋势前抢跑了,但总体上好过了我的预期。现在,我们需要通过回测来查看随着时间推移的真实表现!

5.2 在 11 个样本上回测 LSTM 模型

一旦我们有了能在一个样本上工作的 LSTM 模型,扩展到全部 11 个样本上就相对简单。我们只需创建一个预测函数,再套用到 rolling_origin_resamples 中抽样计划包含的数据上。

5.2.1 构建一个 LSTM 预测函数

这一步看起来很吓人,但实际上很简单。我们将 5.1 节的代码复制到一个函数中。我们将它作为一个安全函数,对于任何长时间运行的函数来说,这是一个很好的做法,可以防止单个故障停止整个过程。

predict_keras_lstm <- function(split,
                                                 epochs = 300,                              
                                                 ...) {        lstm_prediction <- function(split,                                                 epochs,                                
                                                 ...) {                # 5.1.2 Data Setup        df_trn <- training(split)        df_tst <- testing(split)                df <- bind_rows(            df_trn %>% add_column(key = "training"),            df_tst %>% add_column(key = "testing")) %>%             
           as_tbl_time(index = index)                
       # 5.1.3 Preprocessing        rec_obj <- recipe(value ~ ., df) %>%
           step_sqrt(value) %>%            
           step_center(value) %>%            
           step_scale(value) %>%            
           prep()                df_processed_tbl <- bake(rec_obj, df)                center_history <- rec_obj$steps[[2]]$means["value"]        scale_history  <- rec_obj$steps[[3]]$sds["value"]                
       # 5.1.4 LSTM Plan        lag_setting  <- 120 # = nrow(df_tst)        batch_size   <- 40        train_length <- 440        tsteps       <- 1        epochs       <- epochs  
                     # 5.1.5 Train/Test Setup        lag_train_tbl <- df_processed_tbl %>%                                mutate(                                      value_lag = lag(value, n = lag_setting)) %>%                                                  filter(!is.na(value_lag)) %>%                                                  filter(key =="training") %>%                                                  tail(train_length)                x_train_vec <- lag_train_tbl$value_lag        x_train_arr <- array(                                  data = x_train_vec, dim = c(length(x_train_vec), 1, 1))                y_train_vec <- lag_train_tbl$value        y_train_arr <- array(                                  data = y_train_vec, dim = c(length(y_train_vec), 1))                lag_test_tbl <- df_processed_tbl %>%                                  mutate(                                                  value_lag = lag(value, n = lag_setting)) %>%                                                              filter(!is.na(value_lag)) %>%                                                             filter(key =="testing")                x_test_vec <- lag_test_tbl$value_lag        x_test_arr <- array(                                  data = x_test_vec, dim = c(length(x_test_vec), 1, 1))                y_test_vec <- lag_test_tbl$value        y_test_arr <- array(                                  data = y_test_vec, dim = c(length(y_test_vec), 1))                        
                     # 5.1.6 LSTM Model        model <- keras_model_sequential()        model %>%                                  layer_lstm(                                      units            = 50,                        input_shape      = c(tsteps, 1),                        batch_size       = batch_size,                                                      return_sequences = TRUE,                        stateful         = TRUE) %>%                                   layer_lstm(                                      units            = 50,                        return_sequences = FALSE,                        stateful         = TRUE) %>%                                   layer_dense(units = 1)                model %>%                                  compile(loss = 'mae', optimizer = 'adam')                
                     # 5.1.7 Fitting LSTM        for (i in 1:epochs) {            model %>%                                      fit(x          = x_train_arr,                            y          = y_train_arr,                            batch_size = batch_size,                                                              epochs     = 1,                            verbose    = 1,                            shuffle    = FALSE)                        model %>% reset_states()                                      cat("Epoch: ", i)                    }                
                     # 5.1.8 Predict and Return Tidy Data        # Make Predictions        pred_out <- model %>%                                   predict(x_test_arr, batch_size = batch_size) %>%                                  .[,1]                # Retransform values        pred_tbl <- tibble(                                  index = lag_test_tbl$index,                                  value = (pred_out * scale_history + center_history)^2)                # Combine actual data with predictions        tbl_1 <- df_trn %>%                                  add_column(key = "actual")                tbl_2 <- df_tst %>%                                   add_column(key = "actual")                tbl_3 <- pred_tbl %>%                                  add_column(key = "predict")                
                     # Create time_bind_rows() to solve dplyr issue        time_bind_rows <- function(data_1, data_2, index) {            index_expr <- enquo(index)                                      bind_rows(data_1, data_2) %>%                                              as_tbl_time(index = !! index_expr)        }                ret <- list(tbl_1, tbl_2, tbl_3) %>%                                 reduce(time_bind_rows, index = index) %>%                                              arrange(key, index) %>%                                              mutate(key = as_factor(key))        
                     return(ret)            }        safe_lstm <- possibly(lstm_prediction, otherwise = NA)        safe_lstm(split, epochs, ...)     }

我们测试下 predict_keras_lstm() 函数,设置 epochs = 10。返回的数据为长格式,在 key 列中标记有 actual 和 predict

predict_keras_lstm(split, epochs = 10)


## # A time tibble: 840 x 3
## # Index: index
##    index      value key  
##    <date>     <dbl> <fct>
##  1 1949-11-01 144.  actual
##  2 1949-12-01 118.  actual
##  3 1950-01-01 102.  actual
##  4 1950-02-01  94.8 actual
##  5 1950-03-01 110.  actual
##  6 1950-04-01 113.  actual
##  7 1950-05-01 106.  actual
##  8 1950-06-01  83.6 actual
##  9 1950-07-01  91.0 actual
## 10 1950-08-01  85.2 actual
## # ... with 830 more rows

5.2.2 将 LSTM 预测函数应用到 11 个样本上

既然 predict_keras_lstm() 函数可以在一个样本上运行,我们现在可以借助使用 mutate() 和 map() 将函数应用到所有样本上。预测将存储在名为 predict 的列中。注意,这可能需要 5-10 分钟左右才能完成。

sample_predictions_lstm_tbl <- rolling_origin_resamples %>%
    mutate(predict = map(splits, predict_keras_lstm, epochs = 300))

现在,我们得到了 11 个样本的预测,数据存储在列 predict 中。

sample_predictions_lstm_tbl


## # Rolling origin forecast resampling
## # A tibble: 11 x 3
##    splits       id      predict          
##  * <list>       <chr>   <list>            
##  1 <S3: rsplit> Slice01 <tibble [840 x 3]>
##  2 <S3: rsplit> Slice02 <tibble [840 x 3]>
##  3 <S3: rsplit> Slice03 <tibble [840 x 3]>
##  4 <S3: rsplit> Slice04 <tibble [840 x 3]>
##  5 <S3: rsplit> Slice05 <tibble [840 x 3]>
##  6 <S3: rsplit> Slice06 <tibble [840 x 3]>
##  7 <S3: rsplit> Slice07 <tibble [840 x 3]>
##  8 <S3: rsplit> Slice08 <tibble [840 x 3]>
##  9 <S3: rsplit> Slice09 <tibble [840 x 3]>
## 10 <S3: rsplit> Slice10 <tibble [840 x 3]>
## 11 <S3: rsplit> Slice11 <tibble [840 x 3]>

5.2.3 评估回测表现

通过将 calc_rmse() 函数应用到 predict 列上,我们可以得到所有样本的 RMSE。

sample_rmse_tbl <- sample_predictions_lstm_tbl %>%
   mutate(rmse = map_dbl(predict, calc_rmse)) %>%    
   select(id, rmse) sample_rmse_tbl


## # Rolling origin forecast resampling
## # A tibble: 11 x 2
##    id       rmse
##  * <chr>   <dbl>
##  1 Slice01  48.2
##  2 Slice02  17.4
##  3 Slice03  41.0
##  4 Slice04  26.6
##  5 Slice05  22.2
##  6 Slice06  49.0
##  7 Slice07  18.1
##  8 Slice08  54.9
##  9 Slice09  28.0
## 10 Slice10  38.4
## 11 Slice11  34.2

sample_rmse_tbl %>%
   ggplot(aes(rmse)) +    
   geom_histogram(
           aes(y = ..density..),            fill = palette_light()[[1]], bins = 16) +
    geom_density(
           fill = palette_light()[[1]], alpha = 0.5) +
    theme_tq() +    
    ggtitle("Histogram of RMSE")

而且,我们可以总结 11 个样本的 RMSE。专业提示:使用 RMSE(或其他类似指标)的平均值和标准差是比较各种模型表现的好方法。

sample_rmse_tbl %>%
   summarize(
           mean_rmse = mean(rmse),        
           sd_rmse   = sd(rmse))


## # Rolling origin forecast resampling
## # A tibble: 1 x 2
##   mean_rmse sd_rmse
##       <dbl>   <dbl>
## 1      34.4    13.0
5.2.4 可视化回测的结果

我们可以创建一个 plot_predictions() 函数,把 11 个回测样本的预测结果绘制在一副图上!!!

plot_predictions <- function(sampling_tbl,                             predictions_col,                             ncol = 3,
                            alpha = 1,                                                        
                            size = 2,                            
                            base_size = 14,                            
                            title = "Backtested Predictions") {        predictions_col_expr <- enquo(predictions_col)
                                    # Map plot_split() to sampling_tbl    sampling_tbl_with_plots <- sampling_tbl %>%                                           mutate(                                                gg_plots = map2(                !! predictions_col_expr, id,                .f        = plot_prediction,                alpha     = alpha,                size      = size,                base_size = base_size))        # Make plots with cowplot    plot_list <- sampling_tbl_with_plots$gg_plots        p_temp <- plot_list[[1]] + theme(legend.position = "bottom")    legend <- get_legend(p_temp)        p_body  <- plot_grid(plotlist = plot_list, ncol = ncol)                p_title <- ggdraw() +                                                     draw_label(            title,            size = 18,                                            fontface = "bold",                                                        colour = palette_light()[[1]])        g <- plot_grid(        p_title,        p_body,        legend,        ncol = 1,        rel_heights = c(0.05, 1, 0.05))        return(g) }

结果在这里。在一个不容易预测的数据集上,这是相当令人印象深刻的!

sample_predictions_lstm_tbl %>%
   plot_predictions(
           predictions_col = predict,            alpha = 0.5,        
           size = 1,        
           base_size = 10,        
           title = "Keras Stateful LSTM: Backtested Predictions")



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