中药复方/单体研究发表SCI如何突破5分大关?

2017 年 12 月 8 日 外泌体之家

第六期应用网络药理学和生物信息学技术研究中药复方或单体的研讨班

中药复方/单体研究发表SCI如何突破5分大关?

玮瑜独家主办  2018年1月13日-14日(周六日)北京  

 

寄语:

作为国内首个“应用网络药理学和生物信息学技术方法研究中药复方/单体研讨班”的举办单位,我们成功推出了五期,深受广大学员好评,当然深受欢迎的同时也吸引了其他同行的模仿和抄袭,激励着我们去不断调整和优化课程内容。我们决定在2018年1月继续在北京举办,欢迎广大老师同学前来参加,我们共同探讨,共同学习。

课程简介:

中药复方以及中药单体配伍制剂是现代中医治疗疾病的主要方式,它通过潜在的成分-靶点相互作用来治疗各种疾病,在降低不良反应的同时最大化治疗效果。然而,由于中药具有多成份、多靶点的特点,中药发挥药效的作用机制复杂、研究难度大,尤其在SCI论文发表过程中难以获得认可。

近年来,随着网络药理学和生物信息学的发展,将生物信息学技术和网络药理学方法相糅合,联合实验验证成为中药复方机制研究的重要方式之一,在SCI论文发表方面取得了新进展。基于该模式的中药复方研究打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈,使得原先难以定性的机制得以预测和验证。该研究方法适用于各类病症的中药复方/单体治疗机制研究,现已成功发表多篇SCI(IF>5)论文。

与此同时,中药单体和复方的研究成为近年来研究的热点和国家自然基金重点支持的领域,作为临床医生、科研人员和硕博士研究生,尤其是没有生物信息学分析基础和网络药理学基础的初学者,在面对错综复杂的数据时,难免会无从下手,遇到一个小小的技术难点总会卡住很久,研究进度十分缓慢。比如下面这些问题:

(1)如何获得疾病相关靶点(基因、蛋白)信息?如何在众多的靶点中找出关键靶点?

(2)如何获得并筛选中药复方的成分信息?如何预测这些成分的作用靶点?

(3)如何去挖掘成分-靶点、靶点-疾病、靶点-靶点之间的关系?并绘制网络关系图?

(4)如何对网络进行拓扑结构分析、聚类分析和通路富集分析,以阐释中药复方/单体作用机制?

(5)如何利用GEO等生物信息学数据库,在没有R语言基础的情况下实现基因表达谱数据分析和处理,免费挖掘海量数据,为自己的中药复方研究增添亮点?

(6)如何基于医药大数据实现药物重定位,扩展现有中药的应用领域?

(7)如何利用网络药理学和生物信息学的方式,通过大数据挖掘和整合分析,为自己的国自然基金添砖加瓦,充实自身的前期研究基础,增加中标概率?

本次研讨班将带领广大学员,共同学习将网络药理学和生物信息学相结合的中药复方研究思路,突破中药复方SCI文章的5分魔咒。现场操作教学,带领学员解析中药复方作用机制,学员也可以将自己研究的复方带来学习班,利用课间时间解析中药复方作用机制。

 

课程内容、目标与特色:

本次研讨班课程将围绕上述七大问题,严格按照中药复方解析的顺序设计,层层递进,逐步挖掘中药复方的作用机制。本次研讨班全程电脑实战教学,90%以上内容都会涉及到上机指导,无繁琐的理论授课,有超过30种数据库和在线分析工具的使用教学,做到课程学完,就能独立解析中药复方,分析复方/中药单体治疗疾病的潜在分子机制,为后续的实验验证、基金标书的写作提供指导。

 

授课老师:

授课老师幽默风趣,以活泼生动的授课方式呈现枯燥繁杂的理论知识。成功将网络药理学和生物信息学技术相结合,应用于中药复方的机制研究,发表和参与发表多篇5分以上的中药复方机制研究的文章。

适合对象:

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校老师、硕/博士研究生、企业相关研发人员和对网络药理学和生物信息学感兴趣的广大同行。同样适合准备申请国自然、省自然基金,希望能够使用网络药理学和生物信息学的分析手段充实基金前期研究基础,提升基金逻辑性和故事性的老师和同学。尤其适合初学者和无基础的学员,无需学习任何R语言,轻松解析中药复方/单体的作用机制,讲好故事,写好基金,做好课题,发好文章

 

课程设置:

第一天上午:疾病靶点、中药成分等数据的获得,中药成分作用靶点预测

1.      疾病靶点信息获得、靶点信息的标准化、靶点-靶点相互作用关系的获得(多种获取方法和多种疾病相关数据库介绍,上机实战)

2.      中药有效成分的查找和基于ADME参数的成分筛选(包括ADME参数的计算,上机实战)

3.      基于配体结构特征和受体结构特征的中药单成分/化合物靶点预测(包括在线数据库和免费软件的使用,涉及分子对接、结构相似性、基于药效团和数据挖掘等多种靶点预测方法)

 

第一天下午:蛋白-蛋白、成分-靶点网络的构建和网络分析

1.      网络构建过程中数据文件的编排,上机实战

2.      Cytoscape软件详细使用(包括网络图绘制、网络渲染、交集网络构建、子网络提取构建、图片导出和数据导出等,上机实战)

3.      基因共表达网络的构建(上机实战)

4.      网络拓扑结构分析和聚类分析(NetworkAnalyzerMCODEClusterONE的应用,上机实战)

5.       Cytoscape软件相关插件的功能介绍(包括应用ClueGo插件、Reactome插件进行通路富集分析等,上机实战)。

6.       基于DAVID的靶点GO注释分析和KEGG信号通路分析,利用BingoFunrich等进行富集分析和结果绘图,上机实战。

 

第二天上午:生物信息学在中药及单体成分研究中的应用

1.       基于GEO数据库分析疾病相关靶点和中药单体成分作用靶点(包括GEO数据库的简单介绍,GEO基因表达数据的分析,绘制热图,非常适合没有R语言基础的初学者,上机实战)。

2.       基于ConnectivityMap的中药复方或单体成分的药物重定位和机制分析(上机实战)。

3.       Oncomine肿瘤数据库的挖掘。

4.       多种方式绘制维恩图,气泡图、聚类图。包括在线工具、软件等方式,无需任何R语言基础,上机实战。

5.       基于生物信息学发现中药单体活性化合物思路介绍。

 

第二天下午:应用网络药理学研究中药复方作用机制实例及申请基金经验

1.       中药复方网络药理学和生物信息学结合的SCI文章套路学习

2.       应用网络药理学研究中药复方作用机制实例1(上机实战)

3.       应用网络药理学研究中药复方作用机制实例2(上机实战)

4.       网络药理学SCI文章的新思路和亮点介绍

5.       如何将网络药理学或生物信息学应用于基金书写和申请,分享思路

 

备注:自带笔记本电脑,安装WINDOWS操作系统,需要安装Cytoscape3.2.1(需要安装java,安装好Cytoscape插件MCODEClusterONEClueGoReactomeBingo,具体插件报名后告知如何安装)、OfficeExcel 2013等软件。

主办单位

上海玮瑜生物科技有限公司

时间地点

会务时间:2018113-14  12日报到    

会务地点:宝林轩国际大酒店(北京西城区西站南路80号院5号)

住宿: (没有强行规定,可以自订酒店,住宿费用自理)

标准间(含早)380元/人、合住190元/人,费用自理。合住的学员最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。

注册费用:

2800/人。三人以上团体报名2600/人,授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐,晚餐自理。


 报名方式:


请将回执表复制后填写发送到exosomewy@163.com,  邮件主题注明中药复方/单体学习班


 

   

 

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 注册费

大写:    万    千    百    十    元整

小写:        (不含住宿费)

是否需要住宿标红或打√

是□

否□

住宿说明

标红或打√

单人住 □

和本单位人拼房合住 □  

和其他单位学员拼房合住 □

有何其他要求













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