Objective: The n2c2/UW SDOH Challenge explores the extraction of social determinant of health (SDOH) information from clinical notes. The objectives include the advancement of natural language processing (NLP) information extraction techniques for SDOH and clinical information more broadly. This paper presents the shared task, data, participating teams, performance results, and considerations for future work. Materials and Methods: The task used the Social History Annotated Corpus (SHAC), which consists of clinical text with detailed event-based annotations for SDOH events such as alcohol, drug, tobacco, employment, and living situation. Each SDOH event is characterized through attributes related to status, extent, and temporality. The task includes three subtasks related to information extraction (Subtask A), generalizability (Subtask B), and learning transfer (Subtask C). In addressing this task, participants utilized a range of techniques, including rules, knowledge bases, n-grams, word embeddings, and pretrained language models (LM). Results: A total of 15 teams participated, and the top teams utilized pretrained deep learning LM. The top team across all subtasks used a sequence-to-sequence approach achieving 0.901 F1 for Subtask A, 0.774 F1 Subtask B, and 0.889 F1 for Subtask C. Conclusions: Similar to many NLP tasks and domains, pretrained LM yielded the best performance, including generalizability and learning transfer. An error analysis indicates extraction performance varies by SDOH, with lower performance achieved for conditions, like substance use and homelessness, that increase health risks (risk factors) and higher performance achieved for conditions, like substance abstinence and living with family, that reduce health risks (protective factors).


翻译:目标: n2c2/UW SDOH 挑战 探索从临床说明中提取健康的社会决定因素信息(SDOH), 目标包括推进SDOH 的自然语言处理(NLP) 信息提取技术, 以及更广泛的临床信息。 本文介绍了共同的任务、 数据、 参与团队、 绩效结果和今后工作的考量。 材料和方法: 任务使用了社会历史说明 Corpus (SHAC) (SHAC) (SHAC), 包含针对SDOH 事件的详细事件说明, 如酒精、毒品、烟草、就业和生活状况等。 每一次SDOH 事件都通过与状态、程度和时间性有关的属性特征来定性。 任务包括三个子任务: 信息提取(Subtask A)、 通用(Subtask B) 以及学习(Subtask) 等, 使用一系列技术, 包括规则、知识基础、 字型、 字型、字型、字型、 语言模型(LMM) 等。 结果:共有15个团队参加, 和顶级条件使用预先学习LMM。 达到LM。

0
下载
关闭预览

相关内容

《计算机信息》杂志发表高质量的论文,扩大了运筹学和计算的范围,寻求有关理论、方法、实验、系统和应用方面的原创研究论文、新颖的调查和教程论文,以及描述新的和有用的软件工具的论文。官网链接:https://pubsonline.informs.org/journal/ijoc
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
167+阅读 · 2019年10月11日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
99+阅读 · 2019年10月9日
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
征稿 | International Joint Conference on Knowledge Graphs (IJCKG)
开放知识图谱
2+阅读 · 2022年5月20日
全球首个GNN为主的AI创业公司,募资$18.5 million!
图与推荐
1+阅读 · 2022年4月16日
征稿 | CFP:Special Issue of NLP and KG(JCR Q2,IF2.67)
开放知识图谱
1+阅读 · 2022年4月4日
VCIP 2022 Call for Special Session Proposals
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年4月1日
AIART 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年2月13日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
23+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
25+阅读 · 2019年5月18日
深度自进化聚类:Deep Self-Evolution Clustering
我爱读PAMI
14+阅读 · 2019年4月13日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
16+阅读 · 2018年12月24日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
Arxiv
10+阅读 · 2018年4月19日
VIP会员
相关VIP内容
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
167+阅读 · 2019年10月11日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
99+阅读 · 2019年10月9日
相关资讯
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
征稿 | International Joint Conference on Knowledge Graphs (IJCKG)
开放知识图谱
2+阅读 · 2022年5月20日
全球首个GNN为主的AI创业公司,募资$18.5 million!
图与推荐
1+阅读 · 2022年4月16日
征稿 | CFP:Special Issue of NLP and KG(JCR Q2,IF2.67)
开放知识图谱
1+阅读 · 2022年4月4日
VCIP 2022 Call for Special Session Proposals
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年4月1日
AIART 2022 Call for Papers
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年2月13日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
23+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
25+阅读 · 2019年5月18日
深度自进化聚类:Deep Self-Evolution Clustering
我爱读PAMI
14+阅读 · 2019年4月13日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
16+阅读 · 2018年12月24日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员