Fluorescence microscopy is a key driver to promote discoveries of biomedical research. However, with the limitation of microscope hardware and characteristics of the observed samples, the fluorescence microscopy images are susceptible to noise. Recently, a few self-supervised deep learning (DL) denoising methods have been proposed. However, the training efficiency and denoising performance of existing methods are relatively low in real scene noise removal. To address this issue, this paper proposed self-supervised image denoising method Noise2SR (N2SR) to train a simple and effective image denoising model based on single noisy observation. Our Noise2SR denoising model is designed for training with paired noisy images of different dimensions. Benefiting from this training strategy, Noise2SR is more efficiently self-supervised and able to restore more image details from a single noisy observation. Experimental results of simulated noise and real microscopy noise removal show that Noise2SR outperforms two blind-spot based self-supervised deep learning image denoising methods. We envision that Noise2SR has the potential to improve more other kind of scientific imaging quality.


翻译:光纤显微镜是推动生物医学研究发现的一个关键驱动力。然而,由于显微镜硬件和所观测样品特性的限制,荧光显微镜图像很容易受到噪音的影响。最近,提出了一些自我监督的深层学习(DL)脱洞方法。然而,在真实的噪音清除中,现有方法的培训效率和去除功能相对较低。为解决这一问题,本文件提议自我监督的图像脱洞方法Noise2SR(N2SR)以单一噪音观测为基础,训练一个简单有效的图像脱洞模型。我们的噪音2SR脱洞模型是设计用来用不同维度的对齐噪音图像进行训练的。从这一培训战略中受益,Noise2SR更高效地自我监督,能够从单一噪音观测中恢复更多的图像细节。模拟噪音和真实的显微镜去除噪音的实验结果显示,噪音2SR(N2SR)比两种基于自控深层学习图像解洞察的盲点高出两种方法。我们设想,Noise2SR有可能提高其他类型的科学成像质量。

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