扇贝比较细胞遗传学研究

项目名称： 扇贝比较细胞遗传学研究

项目编号： No.31270047

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 黄晓婷

作者单位： 中国海洋大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 扇贝科大约有400个现存种，它们的染色体数目和形态差异显著，是研究染色体进化的好材料。项目组在前期工作的基础上，拟开展以下研究：筛查栉孔扇贝和虾夷扇贝高密度遗传连锁图谱上与性状相关的标记，以及连锁程度较高、难于确定位置关系的标记进行染色体定位，对高密度遗传连锁图谱进行验证和补充；将重复序列、SNP标记以及功能基因定位到虾夷扇贝染色体上，绘制虾夷扇贝细胞遗传学图谱，实现虾夷扇贝单条染色体的识别鉴定；筛查栉孔扇贝和虾夷扇贝高密度遗传连锁图谱上的共享标记，比较两种扇贝的表达谱数据获得共享的基因信息，以及通过全基因组水平系统发生研究获得的共享标签，将这些位点进行染色体定位，讨论扇贝科物种染色体的进化过程。研究结果不仅可以为扇贝遗传育种提供重要的理论依据，也可以为扇贝科系统发生研究提供重要的细胞遗传学证据。

中文关键词： SNP标记；功能基因；重复序列；扇贝；染色体

英文摘要： The family Pectinidae contains about 400 living species. The Chromosome number and karyotype vary considerably which imply the chromosomes of Pectinidae are good material for chromosomal evolution research. In this study, we try to localize SNP loci of high density genetic linkage map by FISH and Fiber-FISH to check the accuracy of linkage map; select repetitive sequences、SNP loci and functional genes to localize by FISH and construct cytogenetic map of Patinopecten yessoensis; compare transcript data and cytogentic map in scallops, analyze homology of the sequences and discuss the karyotype evolution of Pectinidae. Cytogenetic map and comparative cytogenetic analysis would not only contribute to scallop genetic breeding, but also provide cytogenetic evidence for phylogenetic analysis in Pectinidae.

英文关键词： SNP；functional genes；repetitive sequences；scallops；chromosome